152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1790 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1790  PTS system, lactose-specific IIBC components  100 
 
 
582 aa  1174    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D01  cellobiose-specific PTS system IIC component  69.88 
 
 
568 aa  826    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2221  PTS system, lactose-specific IIC subunit  80.76 
 
 
570 aa  974    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2260  PTS system, lactose-specific IIC subunit  80.76 
 
 
570 aa  974    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3458  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  51.3 
 
 
546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0501  cellobiose-specific PTS system IIC component  47.57 
 
 
565 aa  528  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  46.59 
 
 
567 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000105406  hitchhiker  0.00000748526 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  36.71 
 
 
444 aa  252  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.33 
 
 
447 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.35 
 
 
446 aa  240  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.04 
 
 
437 aa  226  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.88 
 
 
437 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4223  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.73 
 
 
439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298661  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0683  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  33.63 
 
 
445 aa  219  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.73344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0037  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.26 
 
 
441 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.908472  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.82 
 
 
442 aa  216  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  30.59 
 
 
451 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.53 
 
 
442 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0526  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.64 
 
 
447 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214594  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0768  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  32.37 
 
 
448 aa  210  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.21 
 
 
438 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.97 
 
 
440 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1256  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.1 
 
 
428 aa  209  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  32.73 
 
 
427 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.73 
 
 
427 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  32.73 
 
 
428 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  32.73 
 
 
428 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.27 
 
 
427 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  32.27 
 
 
427 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.27 
 
 
427 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.5 
 
 
427 aa  203  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  32.27 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.05 
 
 
427 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.13 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.54 
 
 
436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.7 
 
 
436 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.7 
 
 
436 aa  197  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.7 
 
 
436 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.21 
 
 
436 aa  197  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.84 
 
 
436 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.61 
 
 
435 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.17 
 
 
435 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.61 
 
 
435 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.99 
 
 
436 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.21 
 
 
435 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.12 
 
 
434 aa  195  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0437  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.35 
 
 
446 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.1 
 
 
436 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.39 
 
 
435 aa  194  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3522  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.44 
 
 
432 aa  193  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.7 
 
 
434 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30.4 
 
 
436 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1851  cellobiose-specific PTS system IIC component  30.25 
 
 
494 aa  192  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000119261  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B04  chitibiose transporter protein chbC  29.84 
 
 
440 aa  191  2e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.163896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.08 
 
 
435 aa  188  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.03 
 
 
434 aa  187  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.8 
 
 
434 aa  184  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.08 
 
 
435 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.41 
 
 
435 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0534  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.38 
 
 
438 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2996  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.53 
 
 
433 aa  177  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00652008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.38 
 
 
433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  28.96 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.15 
 
 
433 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.15 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  27.97 
 
 
433 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  27.97 
 
 
433 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.52 
 
 
428 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  27.92 
 
 
433 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  27.92 
 
 
433 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  27.97 
 
 
433 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.15 
 
 
433 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.53 
 
 
437 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.15 
 
 
433 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0187  cellobiose phosphotransferase system IIC component  29.93 
 
 
450 aa  161  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00139764  normal  0.0305925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  28.02 
 
 
438 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  29.49 
 
 
433 aa  158  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1430  cellobiose-specific PTS system IIC component  32.13 
 
 
333 aa  158  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000729794  normal  0.124134 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  27.76 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1676  cellobiose-specific PTS system IIC component  28.77 
 
 
440 aa  156  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.486485  normal  0.0322753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  27.48 
 
 
439 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0932  cellobiose phosphotransferase system IIC component  29.57 
 
 
449 aa  154  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0468  cellobiose-specific PTS system IIC component  28.6 
 
 
445 aa  153  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  28.18 
 
 
451 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1634  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.45 
 
 
440 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1619  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.48 
 
 
437 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1738  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.72 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2601  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIC component  27.78 
 
 
450 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0887  PTS system, lactose/cellobiose family IIC component  35 
 
 
277 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47643e-33 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  26.94 
 
 
433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0221  cellobiose phosphotransferase system IIC component  29.05 
 
 
450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.719758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1201  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.03 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1618  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.65 
 
 
437 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0703  PTS system, cellobiose permease IIC component  26.34 
 
 
428 aa  137  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236123  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0570  cellobiose-specific PTS system IIC component  26.34 
 
 
443 aa  133  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.976789  normal  0.163994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  26.85 
 
 
420 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0181  cellobiose-specific PTS system IIC component  25.15 
 
 
494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.113932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  26.68 
 
 
448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3469  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  27.65 
 
 
445 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.868513  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3121  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  26.45 
 
 
429 aa  127  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0071332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>