152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1430 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1430  cellobiose-specific PTS system IIC component  100 
 
 
333 aa  657    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000729794  normal  0.124134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  41.03 
 
 
440 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.34 
 
 
435 aa  255  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.73 
 
 
435 aa  252  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  38.82 
 
 
439 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  40.73 
 
 
438 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  40.48 
 
 
435 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.12 
 
 
434 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.59 
 
 
433 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.98 
 
 
433 aa  245  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.12 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  40.37 
 
 
433 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.82 
 
 
434 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  40.98 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  40.98 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.98 
 
 
433 aa  242  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.98 
 
 
433 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.98 
 
 
433 aa  241  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.67 
 
 
433 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  40.12 
 
 
435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  39.82 
 
 
435 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  39.82 
 
 
435 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.82 
 
 
435 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.28 
 
 
433 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.21 
 
 
435 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  39.21 
 
 
453 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  43.15 
 
 
433 aa  235  8e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3121  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  40.94 
 
 
429 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0071332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  41.77 
 
 
451 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3469  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  38.69 
 
 
445 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.868513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  37.72 
 
 
448 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3282  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  39.22 
 
 
445 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171389  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0756  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  39.05 
 
 
446 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1256  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  42.91 
 
 
428 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  39.44 
 
 
427 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.44 
 
 
427 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.44 
 
 
427 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  39.44 
 
 
427 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.44 
 
 
427 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  40.13 
 
 
427 aa  205  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.44 
 
 
427 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3200  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  39.6 
 
 
441 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  40.7 
 
 
428 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  39.51 
 
 
428 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  39.51 
 
 
428 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  38.82 
 
 
427 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0468  cellobiose-specific PTS system IIC component  34.76 
 
 
445 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0195  cellobiose-specific PTS system IIC component  37.21 
 
 
476 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0622401  normal  0.284293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.18 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.18 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.18 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.71 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  41.18 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.18 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  41.18 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.18 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  41.03 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0187  cellobiose phosphotransferase system IIC component  36.68 
 
 
450 aa  193  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00139764  normal  0.0305925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  42.24 
 
 
434 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1619  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.78 
 
 
437 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1308  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.06 
 
 
442 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.76 
 
 
447 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1738  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.78 
 
 
437 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1634  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.78 
 
 
440 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  38.39 
 
 
427 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  36.6 
 
 
444 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  36.45 
 
 
420 aa  189  8e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  39.93 
 
 
437 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B04  chitibiose transporter protein chbC  34.8 
 
 
440 aa  186  5e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.163896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2996  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  36.17 
 
 
433 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00652008  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0079  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  35.31 
 
 
479 aa  184  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.69 
 
 
446 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0221  cellobiose phosphotransferase system IIC component  37.96 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.719758  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  36.73 
 
 
433 aa  182  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  37.67 
 
 
437 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  36.67 
 
 
437 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  34.68 
 
 
451 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0768  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  32.84 
 
 
448 aa  178  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0887  PTS system, lactose/cellobiose family IIC component  40.64 
 
 
277 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47643e-33 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2601  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIC component  34.19 
 
 
450 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3522  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  36.66 
 
 
432 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0526  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.38 
 
 
447 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214594  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0534  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.81 
 
 
438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0703  PTS system, cellobiose permease IIC component  37.16 
 
 
428 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236123  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1583  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.64 
 
 
437 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1851  cellobiose-specific PTS system IIC component  36.69 
 
 
494 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000119261  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0932  cellobiose phosphotransferase system IIC component  33.76 
 
 
449 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.22 
 
 
438 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1048  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.93 
 
 
433 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.87 
 
 
440 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.12 
 
 
442 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.51 
 
 
442 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2221  PTS system, lactose-specific IIC subunit  34.64 
 
 
570 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2260  PTS system, lactose-specific IIC subunit  34.64 
 
 
570 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4223  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.23 
 
 
439 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298661  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3046  PTS system, IIC component  33.54 
 
 
433 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3458  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.44 
 
 
546 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0037  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30.37 
 
 
441 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.908472  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D01  cellobiose-specific PTS system IIC component  32.9 
 
 
568 aa  159  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  34.77 
 
 
567 aa  159  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000105406  hitchhiker  0.00000748526 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>