152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2260 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1790  PTS system, lactose-specific IIBC components  80.76 
 
 
582 aa  964    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D01  cellobiose-specific PTS system IIC component  71 
 
 
568 aa  833    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2221  PTS system, lactose-specific IIC subunit  100 
 
 
570 aa  1152    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2260  PTS system, lactose-specific IIC subunit  100 
 
 
570 aa  1152    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3458  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  52.31 
 
 
546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0501  cellobiose-specific PTS system IIC component  46.13 
 
 
565 aa  519  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  47.63 
 
 
567 aa  511  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000105406  hitchhiker  0.00000748526 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  36.34 
 
 
444 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.44 
 
 
447 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4223  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.62 
 
 
439 aa  237  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298661  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.63 
 
 
437 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.34 
 
 
446 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.93 
 
 
437 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  31.61 
 
 
451 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32 
 
 
442 aa  223  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.25 
 
 
442 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0768  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  32.82 
 
 
448 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0683  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  33.48 
 
 
445 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.73344  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1256  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.54 
 
 
428 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0037  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.05 
 
 
441 aa  218  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.908472  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0526  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.71 
 
 
447 aa  209  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214594  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.39 
 
 
438 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.16 
 
 
440 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.81 
 
 
428 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.81 
 
 
428 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  33.57 
 
 
427 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.57 
 
 
427 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.94 
 
 
427 aa  203  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  32.38 
 
 
427 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B04  chitibiose transporter protein chbC  31.49 
 
 
440 aa  201  3.9999999999999996e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.163896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.38 
 
 
427 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  33.1 
 
 
427 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.38 
 
 
427 aa  200  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.03 
 
 
436 aa  200  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  32.8 
 
 
436 aa  200  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.8 
 
 
436 aa  200  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  32.8 
 
 
436 aa  200  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.8 
 
 
436 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.73 
 
 
436 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.51 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.28 
 
 
436 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.14 
 
 
427 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1851  cellobiose-specific PTS system IIC component  33.11 
 
 
494 aa  194  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000119261  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.05 
 
 
436 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3522  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29 
 
 
432 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.87 
 
 
435 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.87 
 
 
435 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.35 
 
 
427 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.1 
 
 
435 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.07 
 
 
434 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0437  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.89 
 
 
446 aa  188  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.43 
 
 
435 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.98 
 
 
434 aa  187  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.65 
 
 
435 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.53 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.3 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.53 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.3 
 
 
433 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.3 
 
 
433 aa  184  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  29.07 
 
 
433 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  29.07 
 
 
433 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30.8 
 
 
435 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.3 
 
 
433 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.18 
 
 
434 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.3 
 
 
433 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  30.37 
 
 
440 aa  181  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.96 
 
 
434 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0534  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.44 
 
 
438 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  27.8 
 
 
433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.13 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.73 
 
 
435 aa  173  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2996  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30 
 
 
433 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00652008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.3 
 
 
428 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1430  cellobiose-specific PTS system IIC component  34.64 
 
 
333 aa  166  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000729794  normal  0.124134 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0932  cellobiose phosphotransferase system IIC component  28.6 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0703  PTS system, cellobiose permease IIC component  28.64 
 
 
428 aa  163  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  29.2 
 
 
451 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0187  cellobiose phosphotransferase system IIC component  31.94 
 
 
450 aa  161  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00139764  normal  0.0305925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  28.7 
 
 
438 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.34 
 
 
437 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  27.83 
 
 
453 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0468  cellobiose-specific PTS system IIC component  28.47 
 
 
445 aa  158  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0887  PTS system, lactose/cellobiose family IIC component  37.14 
 
 
277 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47643e-33 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2601  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIC component  27.29 
 
 
450 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1676  cellobiose-specific PTS system IIC component  28.65 
 
 
440 aa  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.486485  normal  0.0322753 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  29 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  27.21 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1634  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.38 
 
 
440 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1619  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.22 
 
 
437 aa  145  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1738  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.45 
 
 
437 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1618  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.28 
 
 
437 aa  143  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0221  cellobiose phosphotransferase system IIC component  28.02 
 
 
450 aa  140  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.719758  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.15 
 
 
433 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1201  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.64 
 
 
439 aa  134  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  25.64 
 
 
420 aa  134  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.81 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1427  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  25.8 
 
 
452 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1442  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  25.8 
 
 
452 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1410  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  25.8 
 
 
452 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal  0.0748148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1858  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  25.8 
 
 
452 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.98931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>