153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1676 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1676  cellobiose-specific PTS system IIC component  100 
 
 
440 aa  883    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.486485  normal  0.0322753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3522  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.85 
 
 
432 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  31.86 
 
 
444 aa  229  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.19 
 
 
447 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.26 
 
 
446 aa  226  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.79 
 
 
437 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  34.23 
 
 
427 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.23 
 
 
427 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.24 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.49 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4223  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.35 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298661  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.09 
 
 
427 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  34.85 
 
 
428 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  34.62 
 
 
427 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  34.85 
 
 
428 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.62 
 
 
427 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.63 
 
 
427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  34.4 
 
 
427 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.16 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0526  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.74 
 
 
447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214594  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.84 
 
 
433 aa  213  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.79 
 
 
428 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.33 
 
 
433 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.33 
 
 
433 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.11 
 
 
433 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.17 
 
 
433 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.11 
 
 
433 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.69 
 
 
433 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.4 
 
 
433 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.7 
 
 
436 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2996  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.59 
 
 
433 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00652008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.48 
 
 
436 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.48 
 
 
436 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.26 
 
 
436 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.48 
 
 
436 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0037  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.25 
 
 
441 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.908472  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.89 
 
 
433 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.7 
 
 
442 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.26 
 
 
436 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.26 
 
 
436 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.26 
 
 
436 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.26 
 
 
436 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.7 
 
 
442 aa  202  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  30.04 
 
 
440 aa  202  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.73 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B04  chitibiose transporter protein chbC  31.38 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.163896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  31.63 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.58 
 
 
438 aa  200  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.58 
 
 
440 aa  199  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.7 
 
 
437 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0437  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.16 
 
 
446 aa  194  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0683  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  31.63 
 
 
445 aa  189  7e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.73344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.71 
 
 
453 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0768  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  31.57 
 
 
448 aa  187  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1256  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.16 
 
 
428 aa  187  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0534  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.86 
 
 
438 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.57 
 
 
420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.05 
 
 
435 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.68 
 
 
434 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  29.23 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.59 
 
 
435 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.38 
 
 
434 aa  171  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  30.18 
 
 
433 aa  170  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1851  cellobiose-specific PTS system IIC component  29.79 
 
 
494 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000119261  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.7 
 
 
434 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.93 
 
 
434 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1201  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.07 
 
 
439 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.36 
 
 
435 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  27.74 
 
 
438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  28.38 
 
 
435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1790  PTS system, lactose-specific IIBC components  27.57 
 
 
582 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  29.13 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  29.13 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.13 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.13 
 
 
435 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1583  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.57 
 
 
437 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  27.38 
 
 
439 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3046  PTS system, IIC component  28.28 
 
 
433 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2221  PTS system, lactose-specific IIC subunit  28.44 
 
 
570 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2260  PTS system, lactose-specific IIC subunit  28.44 
 
 
570 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3200  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.16 
 
 
441 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308848  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0932  cellobiose phosphotransferase system IIC component  28.13 
 
 
449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0501  cellobiose-specific PTS system IIC component  25.97 
 
 
565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0570  cellobiose-specific PTS system IIC component  27.07 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.976789  normal  0.163994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1308  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  27.63 
 
 
442 aa  154  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  26.83 
 
 
448 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0079  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.3 
 
 
479 aa  151  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1618  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.25 
 
 
437 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D01  cellobiose-specific PTS system IIC component  25.4 
 
 
568 aa  149  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0195  cellobiose-specific PTS system IIC component  29.35 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0622401  normal  0.284293 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0181  cellobiose-specific PTS system IIC component  27.83 
 
 
494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.113932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3458  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  26.24 
 
 
546 aa  147  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  26.76 
 
 
567 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000105406  hitchhiker  0.00000748526 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0756  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  27.73 
 
 
446 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3469  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  26.7 
 
 
445 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.868513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3282  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  28.67 
 
 
445 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171389  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1619  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  28.07 
 
 
437 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1634  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  28.07 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0703  PTS system, cellobiose permease IIC component  31.31 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236123  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0187  cellobiose phosphotransferase system IIC component  26.62 
 
 
450 aa  141  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00139764  normal  0.0305925 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>