153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0901 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  88.96 
 
 
444 aa  779    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  100 
 
 
446 aa  889    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  90.38 
 
 
447 aa  791    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  54.37 
 
 
437 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  54.61 
 
 
437 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  48.03 
 
 
442 aa  471  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  51.2 
 
 
438 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  51.2 
 
 
440 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0037  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  48.06 
 
 
441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.908472  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4223  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  52.18 
 
 
439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298661  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  47.69 
 
 
442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0526  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  52.05 
 
 
447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214594  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  42.18 
 
 
451 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0437  PTS system, cellobiose-specific IIC component  44.24 
 
 
446 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B04  chitibiose transporter protein chbC  39.03 
 
 
440 aa  332  9e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.163896  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0768  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  38.34 
 
 
448 aa  322  6e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3522  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  38.43 
 
 
432 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0683  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  39.64 
 
 
445 aa  316  5e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.73344  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1256  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  38.52 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  38.88 
 
 
437 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.64 
 
 
433 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  38.81 
 
 
433 aa  299  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  37.96 
 
 
427 aa  298  9e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  37.96 
 
 
427 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  39.04 
 
 
433 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.18 
 
 
433 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  39.04 
 
 
433 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.17 
 
 
427 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  39.11 
 
 
427 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.95 
 
 
433 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.95 
 
 
433 aa  295  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.95 
 
 
433 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  39.77 
 
 
428 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  39.77 
 
 
428 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.36 
 
 
433 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  39.63 
 
 
427 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.63 
 
 
427 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.5 
 
 
433 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.34 
 
 
427 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  39.4 
 
 
427 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  38.5 
 
 
434 aa  283  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.66 
 
 
435 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.6 
 
 
428 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  37.96 
 
 
435 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  36.79 
 
 
434 aa  279  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.64 
 
 
453 aa  279  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  37.47 
 
 
427 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  36.12 
 
 
434 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  36.12 
 
 
440 aa  276  7e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.37 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  36.12 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.15 
 
 
436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.55 
 
 
436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.92 
 
 
436 aa  273  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.15 
 
 
436 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  35.32 
 
 
436 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.32 
 
 
436 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  35.32 
 
 
436 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.32 
 
 
436 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  36.3 
 
 
435 aa  269  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  36.3 
 
 
435 aa  269  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  38.06 
 
 
451 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.67 
 
 
435 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.3 
 
 
435 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0534  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.51 
 
 
438 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  36.3 
 
 
435 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  36.07 
 
 
435 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  36.07 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1790  PTS system, lactose-specific IIBC components  35.35 
 
 
582 aa  256  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2221  PTS system, lactose-specific IIC subunit  34.34 
 
 
570 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2260  PTS system, lactose-specific IIC subunit  34.34 
 
 
570 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2996  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.33 
 
 
433 aa  249  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00652008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3458  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.11 
 
 
546 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308531  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D01  cellobiose-specific PTS system IIC component  34.27 
 
 
568 aa  243  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.43 
 
 
420 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1676  cellobiose-specific PTS system IIC component  32.26 
 
 
440 aa  231  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.486485  normal  0.0322753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.29 
 
 
439 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  31.99 
 
 
438 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1201  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.49 
 
 
439 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1851  cellobiose-specific PTS system IIC component  30.84 
 
 
494 aa  210  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000119261  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3200  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.4 
 
 
441 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3469  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.25 
 
 
445 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.868513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.56 
 
 
433 aa  206  7e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  31.81 
 
 
567 aa  206  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000105406  hitchhiker  0.00000748526 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0501  cellobiose-specific PTS system IIC component  28.34 
 
 
565 aa  205  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3282  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.21 
 
 
445 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171389  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.62 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1410  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  31.35 
 
 
452 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal  0.0748148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1858  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  31.35 
 
 
452 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.98931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2031  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  31.35 
 
 
452 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1442  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  31.35 
 
 
452 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1427  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  31.35 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0887  PTS system, lactose/cellobiose family IIC component  39.41 
 
 
277 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47643e-33 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1430  cellobiose-specific PTS system IIC component  35.89 
 
 
333 aa  196  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000729794  normal  0.124134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0756  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.13 
 
 
446 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0932  cellobiose phosphotransferase system IIC component  32.95 
 
 
449 aa  196  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0703  PTS system, cellobiose permease IIC component  32.41 
 
 
428 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1618  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.44 
 
 
437 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1619  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.81 
 
 
437 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1738  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.04 
 
 
437 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>