153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2270 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  98.59 
 
 
427 aa  845    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  94.86 
 
 
428 aa  800    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  95.08 
 
 
427 aa  804    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  94.61 
 
 
427 aa  799    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  94.86 
 
 
428 aa  800    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  98.83 
 
 
427 aa  847    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  89.67 
 
 
427 aa  753    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  95.08 
 
 
427 aa  804    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  100 
 
 
427 aa  853    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  95.55 
 
 
427 aa  805    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  98.59 
 
 
427 aa  845    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1256  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  51.4 
 
 
428 aa  422  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  48.39 
 
 
437 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  44.7 
 
 
436 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  44.7 
 
 
436 aa  333  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  44.7 
 
 
436 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  44.91 
 
 
436 aa  332  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  44.91 
 
 
436 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  44.91 
 
 
436 aa  332  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  44.91 
 
 
436 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  44.47 
 
 
436 aa  332  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  45.01 
 
 
436 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  43.95 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  42.69 
 
 
437 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  42.23 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.34 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  41.34 
 
 
433 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.34 
 
 
433 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  41.34 
 
 
433 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  41.11 
 
 
433 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.11 
 
 
433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.11 
 
 
433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1851  cellobiose-specific PTS system IIC component  41.61 
 
 
494 aa  309  8e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000119261  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4223  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  44.08 
 
 
439 aa  308  9e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298661  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.88 
 
 
433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  40.65 
 
 
433 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  41.34 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  40.64 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2996  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  41.16 
 
 
433 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00652008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  40.48 
 
 
444 aa  299  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0526  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  40.5 
 
 
447 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214594  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.34 
 
 
447 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  37.8 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  39.11 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  39.72 
 
 
439 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.75 
 
 
435 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  38.14 
 
 
435 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  37.07 
 
 
434 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  36.61 
 
 
434 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.03 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  37.27 
 
 
434 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.44 
 
 
440 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.14 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.02 
 
 
442 aa  262  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.2 
 
 
438 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  37.35 
 
 
435 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.57 
 
 
435 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  36.01 
 
 
440 aa  259  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  37.12 
 
 
435 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  37.12 
 
 
435 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0534  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  39.49 
 
 
438 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  37.12 
 
 
435 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0768  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  35.98 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.88 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  36.12 
 
 
451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  37.26 
 
 
420 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B04  chitibiose transporter protein chbC  34.97 
 
 
440 aa  248  1e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.163896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0037  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.41 
 
 
441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.908472  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  37.79 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  34.7 
 
 
438 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0887  PTS system, lactose/cellobiose family IIC component  50 
 
 
277 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47643e-33 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0932  cellobiose phosphotransferase system IIC component  35.43 
 
 
449 aa  233  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1619  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.77 
 
 
437 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3522  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.03 
 
 
432 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1738  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.01 
 
 
437 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1634  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.01 
 
 
440 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0437  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.4 
 
 
446 aa  223  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2601  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIC component  35.11 
 
 
450 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0683  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  33.26 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.73344  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0199  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.94 
 
 
439 aa  219  7e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0187  cellobiose phosphotransferase system IIC component  33.19 
 
 
450 aa  218  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00139764  normal  0.0305925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.73 
 
 
448 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0181  cellobiose-specific PTS system IIC component  31.49 
 
 
494 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.113932  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1676  cellobiose-specific PTS system IIC component  34.09 
 
 
440 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.486485  normal  0.0322753 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0570  cellobiose-specific PTS system IIC component  30.49 
 
 
443 aa  210  4e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.976789  normal  0.163994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3200  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.26 
 
 
441 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1430  cellobiose-specific PTS system IIC component  40.13 
 
 
333 aa  205  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000729794  normal  0.124134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1201  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.78 
 
 
439 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0195  cellobiose-specific PTS system IIC component  33.19 
 
 
476 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0622401  normal  0.284293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3469  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.19 
 
 
445 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.868513  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0756  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  35.77 
 
 
446 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1895  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  30.44 
 
 
452 aa  203  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.677807  normal  0.163487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01706  N,N'-diacetylchitobiose-specific enzyme IIC component of PTS  30.44 
 
 
452 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1905  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.44 
 
 
452 aa  202  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1790  PTS system, lactose-specific IIBC components  32.05 
 
 
582 aa  202  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.1 
 
 
433 aa  202  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1819  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  30.44 
 
 
452 aa  202  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.687565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1958  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  30.44 
 
 
452 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1454  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  30.44 
 
 
452 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.262654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01694  hypothetical protein  30.44 
 
 
452 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>