77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2765 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2765  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 		 189 aa  91.7  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1831  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000890359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1968  mutT/nudix family protein  30.85 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3359  mutT/nudix family protein  30.85 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.039473  hitchhiker  0.00000000000000713164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1781  MutT/Nudix family protein  30.27 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1823  mutT/nudix family protein  30.27 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00460593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1964  mutT/nudix family protein  30.27 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000761489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2070  mutT/nudix family protein  31.35 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000173279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1798  MutT/Nudix family protein  30.27 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2000  mutT/nudix family protein  30.27 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7905499999999994e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2049  mutT/nudix family protein  30.35 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00026256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2877  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  45.16 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  31.71 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  39.56 
 
 		 459 aa  54.7  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  42.57 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.08 
 
 		 171 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.46 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  35.64 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  41.89 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.48 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  38.27 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.56 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1919  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.68 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.353354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  38.71 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1019  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  45.45 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  37.76 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.06 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  36.26 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.96 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0774  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  39.78 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 169 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.57 
 
 		 179 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  40.82 
 
 		 191 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  38.24 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  31.18 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.31 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.48 
 
 		 172 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11763  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.08 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.92 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.92 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2726  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  37.63 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 284 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  22.64 
 
 		 174 aa  42.4  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.42 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4870  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  38.04 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0257995  normal  0.425035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  40.74 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.38 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0419  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  35.42 
 
 		 187 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1842  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.67 
 
 		 181 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 288 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  37.63 
 
 		 181 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 288 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 288 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 283 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>