258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3396 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3396  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
266 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3658  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  98.12 
 
 
266 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4475  HpcH/HpaI aldolase  36.61 
 
 
273 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000552793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2327  HpcH/HpaI aldolase  33.83 
 
 
263 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6606  HpcH/HpaI aldolase  31.37 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0826  HpcH/HpaI aldolase  34.9 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.146746  unclonable  0.000000000657155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.69 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  30.36 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2944  putative aldolase  30.18 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711573  normal  0.972329 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2073  HpcH/HpaI aldolase  31.76 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6846  HpcH/HpaI aldolase  31.74 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3771  HpcH/HpaI aldolase  32.66 
 
 
261 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0497  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.89 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1241  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.85 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2830  HpcH/HpaI aldolase  29.5 
 
 
273 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2673  HpcH/HpaI aldolase  36.46 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1789  HpcH/HpaI aldolase  30.96 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17043  normal  0.157768 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05544  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0532227  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2399  putative aldolase  32 
 
 
267 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4324  HpcH/HpaI aldolase  29.92 
 
 
269 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0716  putative aldolase  37.82 
 
 
253 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0565774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6953  HpcH/HpaI aldolase  32.93 
 
 
259 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2345  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.8 
 
 
268 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1700  HpcH/HpaI aldolase  30.3 
 
 
258 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00850  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 
269 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3924  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  32.22 
 
 
265 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.782529  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05295  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 
277 aa  105  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2588  HpcH/HpaI aldolase  32.38 
 
 
258 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0901158  hitchhiker  0.00712215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3145  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30 
 
 
253 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.462882  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1624  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.67 
 
 
253 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2482  HpcH/HpaI aldolase  30.57 
 
 
254 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2181  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.49 
 
 
272 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4276  HpcH/HpaI aldolase  29.96 
 
 
258 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0400534  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02171  predicted 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32 
 
 
267 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1413  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32 
 
 
267 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1404  putative aldolase  32 
 
 
267 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1711  HpcH/HpaI aldolase  32.88 
 
 
258 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2387  putative aldolase  32 
 
 
267 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3079  HpcH/HpaI aldolase  31.42 
 
 
261 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02130  hypothetical protein  32 
 
 
267 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.63 
 
 
255 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2517  putative aldolase  30.8 
 
 
267 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2425  putative aldolase  30.8 
 
 
267 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2474  putative aldolase  30.8 
 
 
267 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2529  putative aldolase  30.8 
 
 
267 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.388708  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3135  HpcH/HpaI aldolase  33.61 
 
 
254 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4400  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  31.6 
 
 
265 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125493  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2633  putative aldolase  30.4 
 
 
267 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.952271  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1797  HpcH/HpaI aldolase  31.75 
 
 
250 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  0.716288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  29.57 
 
 
256 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7363  HpcH/HpaI aldolase  28.68 
 
 
263 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.431693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3613  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.33 
 
 
270 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2285  HpcH/HpaI aldolase  30.54 
 
 
251 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1422  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.05 
 
 
256 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0413862 
 
 
-
 
NC_003296  RS00880  aldolase protein  36.96 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0143693  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3525  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.12 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4065  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.95 
 
 
256 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.62895 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1613  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase protein  30.8 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137402  normal  0.0298275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1881  HpcH/HpaI aldolase  30.89 
 
 
254 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5787  HpcH/HpaI aldolase  33.94 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0389238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2034  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase(HpaI)  31.14 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0580276  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6690  HpcH/HpaI aldolase  32.88 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0452123  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1591  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase oxidoreductase protein  29.8 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.365459  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02070  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.413309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0519  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.95 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000218683  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1954  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.21 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.505827  normal  0.0223643 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0585  HpcH/HpaI aldolase  33.64 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1950  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.02 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0974  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.91 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0239  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.48 
 
 
273 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3707  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.36 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1181  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.28 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4885  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.36 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2080  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.26 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.616363  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1065  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.28 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1201  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.28 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.771297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04225  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.36 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00240  aldolase, putative  29.2 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3014  putative aldolase protein  30.2 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04191  hypothetical protein  29.36 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3586  HpcH/HpaI aldolase  34.43 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  28.74 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4579  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.36 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.05 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  28.74 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0323  HpcH/HpaI aldolase  27.67 
 
 
263 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187244  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3511  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.33 
 
 
256 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05330  conserved hypothetical protein  35.52 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0941  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.4 
 
 
272 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3439  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.33 
 
 
256 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1170  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.82 
 
 
263 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1626  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.28 
 
 
268 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948231  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2317  HpcH/HpaI aldolase  33.06 
 
 
264 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.542769  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3442  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.33 
 
 
256 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3608  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.33 
 
 
256 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  0.699221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1071  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  27.03 
 
 
257 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3547  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.33 
 
 
256 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293862  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02991  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.02 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3421  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.02 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3223  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.8 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>