259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4781 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0716  putative aldolase  68.77 
 
 
253 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0565774 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2673  HpcH/HpaI aldolase  57.2 
 
 
258 aa  280  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2588  HpcH/HpaI aldolase  52.4 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0901158  hitchhiker  0.00712215 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  48.62 
 
 
259 aa  248  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  48.62 
 
 
259 aa  248  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3089  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  48 
 
 
256 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0555789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3135  HpcH/HpaI aldolase  46.06 
 
 
254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0585  HpcH/HpaI aldolase  40.65 
 
 
259 aa  194  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170473  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00880  aldolase protein  47.22 
 
 
267 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0143693  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1111  HpcH/HpaI aldolase  46.38 
 
 
251 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0589091  normal  0.717046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01933  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  45.8 
 
 
253 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09360  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase, HpcH/HpaI family  46.9 
 
 
258 aa  175  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6953  HpcH/HpaI aldolase  40.32 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3604  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  37.6 
 
 
256 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3421  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  37.6 
 
 
256 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3232  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  37.6 
 
 
257 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4438  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  37.2 
 
 
256 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.867031  normal  0.323849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3547  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  38.4 
 
 
256 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293862  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3442  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  38.4 
 
 
256 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3608  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  38.4 
 
 
256 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  0.699221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3439  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  38.4 
 
 
256 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3511  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  38.4 
 
 
256 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02991  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  37.2 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0579  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  37.2 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0574  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  37.2 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02942  hypothetical protein  37.2 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3315  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  37.2 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3554  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  38.74 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0844  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  37.65 
 
 
256 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3568  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  36.8 
 
 
256 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.809818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3394  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  38.34 
 
 
256 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2073  HpcH/HpaI aldolase  35.19 
 
 
258 aa  148  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0810  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  37.25 
 
 
256 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1241  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  37.75 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4475  HpcH/HpaI aldolase  41.25 
 
 
273 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000552793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  43.43 
 
 
264 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  36.51 
 
 
256 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
254 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1457  HpcH/HpaI aldolase  41.54 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3463  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  40.49 
 
 
254 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1633  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  34.84 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4400  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  34.62 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125493  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3113  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  38.46 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2317  HpcH/HpaI aldolase  36.62 
 
 
264 aa  135  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.542769  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1499  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  40.49 
 
 
266 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3223  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  41.33 
 
 
266 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1595  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.33 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3171  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.65 
 
 
261 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3054  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.65 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1776  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.06 
 
 
254 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170992  normal  0.538418 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2474  putative aldolase  34.72 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2529  putative aldolase  34.72 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.388708  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2425  putative aldolase  34.08 
 
 
267 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2399  putative aldolase  33.98 
 
 
267 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1881  HpcH/HpaI aldolase  32.87 
 
 
254 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2517  putative aldolase  34.08 
 
 
267 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343129  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2633  putative aldolase  33.71 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.952271  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2181  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  37.98 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2640  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.51 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.989277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02171  predicted 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.36 
 
 
267 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1413  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.36 
 
 
267 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2387  putative aldolase  34.36 
 
 
267 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6606  HpcH/HpaI aldolase  31.62 
 
 
274 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02130  hypothetical protein  34.36 
 
 
267 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1789  HpcH/HpaI aldolase  37.32 
 
 
260 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17043  normal  0.157768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1404  putative aldolase  34.36 
 
 
267 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2482  HpcH/HpaI aldolase  34.85 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6467  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.25 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6527  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  38.39 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3079  HpcH/HpaI aldolase  34.63 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3911  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  40.38 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0068475  normal  0.0363616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2517  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  38.16 
 
 
254 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0292  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.23 
 
 
269 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419206  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3771  HpcH/HpaI aldolase  34.45 
 
 
261 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3658  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.66 
 
 
266 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2049  HpcH/HpaI aldolase  35.02 
 
 
267 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0507  putative HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 
253 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208943  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2502  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  37.5 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3116  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  37.5 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6205  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.46 
 
 
256 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424474  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3396  HpcH/HpaI aldolase  36.22 
 
 
266 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.2 
 
 
255 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09230  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  36.63 
 
 
301 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1057  HpcH/HpaI aldolase  40.46 
 
 
257 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3014  putative aldolase protein  35.74 
 
 
250 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0826  HpcH/HpaI aldolase  35.11 
 
 
267 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.146746  unclonable  0.000000000657155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0497  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.15 
 
 
268 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3132  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  37.02 
 
 
261 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3855  HpcH/HpaI aldolase  34.17 
 
 
253 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3886  HpcH/HpaI aldolase  39.78 
 
 
262 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21023  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1422  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.21 
 
 
256 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0413862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3301  putative aldolase  33.98 
 
 
278 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3398  HpcH/HpaI aldolase  33.98 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0320  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.42 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3103  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  34.4 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1628  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  37.44 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.5135  normal  0.22665 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05295  conserved hypothetical protein  36.11 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4135  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  36.45 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.960195  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5927  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.21 
 
 
264 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>