259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0507 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0507  putative HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
253 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208943  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3855  HpcH/HpaI aldolase  45.53 
 
 
253 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2586  HpcH/HpaI aldolase  43.9 
 
 
251 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3485  HpcH/HpaI aldolase  45.64 
 
 
249 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.547567  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02555  hypothetical protein  37.66 
 
 
249 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0115  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 
263 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3771  HpcH/HpaI aldolase  39.08 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0838  HpcH/HpaI aldolase  46.38 
 
 
269 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3060  HpcH/HpaI aldolase  41.13 
 
 
244 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388501  normal  0.0341829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2691  HpcH/HpaI aldolase  35 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3740  HpcH/HpaI aldolase  37.66 
 
 
250 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3014  putative aldolase protein  37.66 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1457  HpcH/HpaI aldolase  39.15 
 
 
279 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  36.87 
 
 
264 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  30.36 
 
 
254 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2482  HpcH/HpaI aldolase  32.75 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.74 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1071  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  26.8 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3911  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.47 
 
 
293 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0068475  normal  0.0363616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3136  HpcH/HpaI aldolase  36.28 
 
 
254 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3568  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.12 
 
 
256 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.809818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  29.39 
 
 
256 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4475  HpcH/HpaI aldolase  32.65 
 
 
273 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000552793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.49 
 
 
255 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1624  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.51 
 
 
253 aa  105  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1422  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.39 
 
 
256 aa  105  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0413862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4270  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.47 
 
 
271 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.755351  normal  0.6903 
 
 
-
 
NC_003296  RS00880  aldolase protein  38.92 
 
 
267 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0143693  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3439  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.12 
 
 
256 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6953  HpcH/HpaI aldolase  31.49 
 
 
259 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3608  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.12 
 
 
256 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  0.699221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3547  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.12 
 
 
256 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3511  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.12 
 
 
256 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10570  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.17 
 
 
268 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0826  HpcH/HpaI aldolase  33.62 
 
 
267 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.146746  unclonable  0.000000000657155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3442  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.12 
 
 
256 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2166  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.23 
 
 
253 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0915236  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3223  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.95 
 
 
266 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.17 
 
 
266 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1189  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.4 
 
 
265 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  26.72 
 
 
259 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  26.72 
 
 
259 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3554  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.32 
 
 
256 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3421  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.92 
 
 
256 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0970  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.88 
 
 
258 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  0.0128827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3604  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.92 
 
 
256 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0574  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.92 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02991  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.92 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0579  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.92 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02942  hypothetical protein  28.92 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0810  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.12 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3315  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.92 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3394  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.32 
 
 
256 aa  99  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3087  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.76 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.178883  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4438  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.51 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.867031  normal  0.323849 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0871  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  31.28 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1595  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.99 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3463  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.34 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5698  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  32.44 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2588  HpcH/HpaI aldolase  27.73 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0901158  hitchhiker  0.00712215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0475  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.77 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0844  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.32 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6205  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.2 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424474  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3232  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.51 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3719  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.07 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6467  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.93 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1633  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.65 
 
 
261 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0429  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.04 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2073  HpcH/HpaI aldolase  25.5 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3924  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  29.92 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.782529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0585  HpcH/HpaI aldolase  28.15 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1499  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.33 
 
 
266 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1628  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.2 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.5135  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1599  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.95 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4400  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  27.27 
 
 
265 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125493  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2181  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.34 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0189  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.11 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.930897  normal  0.977626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1789  HpcH/HpaI aldolase  29.29 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17043  normal  0.157768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2399  putative aldolase  31.65 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1111  HpcH/HpaI aldolase  31.65 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0589091  normal  0.717046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0320  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.98 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02171  predicted 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.65 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1413  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.65 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1613  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase protein  29.27 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137402  normal  0.0298275 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1404  putative aldolase  31.65 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3103  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.75 
 
 
260 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2387  putative aldolase  31.65 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02130  hypothetical protein  31.65 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4446  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.33 
 
 
268 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0830561 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2317  HpcH/HpaI aldolase  31.12 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.542769  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1475  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.91 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20030  2,4-dihydroxyhept-2-enedioate aldolase  33.81 
 
 
286 aa  91.3  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4860  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.4 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.470101  normal  0.16217 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3396  HpcH/HpaI aldolase  30.36 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0497  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.98 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3577  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.3 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1776  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.96 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170992  normal  0.538418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3135  HpcH/HpaI aldolase  26.45 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4404  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.79 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2529  putative aldolase  29.66 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.388708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>