262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3089 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3089  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  100 
 
 
256 aa  507  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0555789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09360  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase, HpcH/HpaI family  81.1 
 
 
258 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01933  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  60.85 
 
 
253 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3135  HpcH/HpaI aldolase  53.53 
 
 
254 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  48 
 
 
259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2588  HpcH/HpaI aldolase  41.04 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0901158  hitchhiker  0.00712215 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  36.95 
 
 
259 aa  185  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  36.95 
 
 
259 aa  185  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2673  HpcH/HpaI aldolase  40.16 
 
 
258 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0716  putative aldolase  46.64 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0565774 
 
 
-
 
NC_003296  RS00880  aldolase protein  39.22 
 
 
267 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0143693  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1111  HpcH/HpaI aldolase  38.89 
 
 
251 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0589091  normal  0.717046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0585  HpcH/HpaI aldolase  33.73 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6953  HpcH/HpaI aldolase  34.44 
 
 
259 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2073  HpcH/HpaI aldolase  31.86 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.68 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1071  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  30.08 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2482  HpcH/HpaI aldolase  28.57 
 
 
254 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4475  HpcH/HpaI aldolase  30.12 
 
 
273 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000552793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1241  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.91 
 
 
259 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3223  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.06 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0320  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.92 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05295  conserved hypothetical protein  32.11 
 
 
277 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3054  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.95 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6467  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.56 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3113  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.56 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3171  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.95 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.16 
 
 
255 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3398  HpcH/HpaI aldolase  32.05 
 
 
262 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  25.83 
 
 
254 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3547  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.35 
 
 
256 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3511  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.35 
 
 
256 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3442  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.35 
 
 
256 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3439  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.35 
 
 
256 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3608  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.35 
 
 
256 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  0.699221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3132  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.95 
 
 
261 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2502  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.56 
 
 
261 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3116  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.56 
 
 
261 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2399  putative aldolase  28.57 
 
 
267 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02171  predicted 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.57 
 
 
267 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1413  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.57 
 
 
267 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2387  putative aldolase  28.57 
 
 
267 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02130  hypothetical protein  28.57 
 
 
267 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4404  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.54 
 
 
260 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2317  HpcH/HpaI aldolase  33.97 
 
 
264 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.542769  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1404  putative aldolase  28.57 
 
 
267 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0826  HpcH/HpaI aldolase  29.76 
 
 
267 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.146746  unclonable  0.000000000657155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0189  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  36.52 
 
 
279 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.930897  normal  0.977626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0519  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  26.98 
 
 
255 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000218683  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6527  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.71 
 
 
261 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1057  HpcH/HpaI aldolase  29.2 
 
 
257 aa  101  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3568  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.4 
 
 
256 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.809818 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4400  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.57 
 
 
265 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125493  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3658  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.2 
 
 
266 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0292  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.86 
 
 
269 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419206  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2517  putative aldolase  28.79 
 
 
267 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2425  putative aldolase  28.79 
 
 
267 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3079  HpcH/HpaI aldolase  29.63 
 
 
261 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3232  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.6 
 
 
257 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2633  putative aldolase  28.57 
 
 
267 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.952271  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3396  HpcH/HpaI aldolase  33.2 
 
 
266 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2474  putative aldolase  27.67 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2529  putative aldolase  27.67 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.388708  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1633  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.88 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3421  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.6 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3604  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.6 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1789  HpcH/HpaI aldolase  30 
 
 
260 aa  99  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17043  normal  0.157768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1499  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  32.75 
 
 
266 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4438  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.2 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.867031  normal  0.323849 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02991  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.6 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0579  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.6 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0046  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.42 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3145  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.96 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.462882  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2181  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.4 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02942  hypothetical protein  29.6 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3315  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.6 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3301  putative aldolase  28.57 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  31.49 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4207  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.73 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102546  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0574  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.2 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0844  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.28 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3554  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.12 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3394  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.12 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0497  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.1 
 
 
268 aa  95.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1595  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  24.02 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1647  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.8 
 
 
260 aa  95.1  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000936212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0070  HpcH/HpaI aldolase  32.21 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0810  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  27.05 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6846  HpcH/HpaI aldolase  33.14 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3561  aldolase  30.68 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3771  HpcH/HpaI aldolase  29.71 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1122  HpcH/HpaI aldolase  27.13 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.597094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3613  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.48 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4324  HpcH/HpaI aldolase  27.42 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09230  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.71 
 
 
301 aa  92  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2830  HpcH/HpaI aldolase  26.59 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3103  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.53 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2503  HpcH/HpaI aldolase  29.1 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2640  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.02 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0156  HpcH/HpaI aldolase family protein  32.16 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>