259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6606 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6606  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4324  HpcH/HpaI aldolase  68.75 
 
 
269 aa  381  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4475  HpcH/HpaI aldolase  34.24 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000552793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1241  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.94 
 
 
259 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2588  HpcH/HpaI aldolase  32.17 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0901158  hitchhiker  0.00712215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0826  HpcH/HpaI aldolase  33.99 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.146746  unclonable  0.000000000657155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.62 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.97 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  28.92 
 
 
254 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02130  hypothetical protein  30.68 
 
 
267 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02171  predicted 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.68 
 
 
267 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1413  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.68 
 
 
267 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1404  putative aldolase  30.68 
 
 
267 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2387  putative aldolase  30.68 
 
 
267 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1789  HpcH/HpaI aldolase  29.84 
 
 
260 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17043  normal  0.157768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2399  putative aldolase  30.04 
 
 
267 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3301  putative aldolase  31.37 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2673  HpcH/HpaI aldolase  31.88 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0429  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.2 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3396  HpcH/HpaI aldolase  31.37 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2474  putative aldolase  28.92 
 
 
267 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2529  putative aldolase  28.92 
 
 
267 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.388708  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3771  HpcH/HpaI aldolase  33.61 
 
 
261 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2517  putative aldolase  28.92 
 
 
267 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343129  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2633  putative aldolase  28.92 
 
 
267 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.952271  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2425  putative aldolase  28.92 
 
 
267 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3658  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.37 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1422  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.69 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0413862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1071  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  27.87 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2640  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.17 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0519  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.74 
 
 
255 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000218683  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2421  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.17 
 
 
254 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0115  HpcH/HpaI aldolase  29.53 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1595  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  24.41 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3394  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.45 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1613  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase protein  29.27 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137402  normal  0.0298275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2830  HpcH/HpaI aldolase  27.31 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  28.03 
 
 
256 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4400  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  30.28 
 
 
265 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2073  HpcH/HpaI aldolase  29.8 
 
 
258 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2482  HpcH/HpaI aldolase  30.93 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2181  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.09 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4207  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  26.38 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102546  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1122  HpcH/HpaI aldolase  32.29 
 
 
265 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.597094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0497  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.2 
 
 
268 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.92 
 
 
264 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1628  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.25 
 
 
255 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.5135  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3554  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.63 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3113  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.52 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0323  HpcH/HpaI aldolase  28.81 
 
 
263 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187244  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05295  conserved hypothetical protein  34.12 
 
 
277 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00880  aldolase protein  34.74 
 
 
267 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0143693  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2944  putative aldolase  27.34 
 
 
259 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711573  normal  0.972329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2327  HpcH/HpaI aldolase  29.82 
 
 
263 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6467  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  26.67 
 
 
261 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6690  HpcH/HpaI aldolase  34.11 
 
 
263 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0452123  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0239  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.46 
 
 
273 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1950  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.08 
 
 
267 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2317  HpcH/HpaI aldolase  31.34 
 
 
264 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.542769  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0716  putative aldolase  31.35 
 
 
253 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0565774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4404  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.2 
 
 
260 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  31.09 
 
 
259 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  31.09 
 
 
259 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0844  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  27.62 
 
 
256 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6527  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27 
 
 
261 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6846  HpcH/HpaI aldolase  25.78 
 
 
265 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46590  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.68 
 
 
265 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2470  HpcH/HpaI aldolase  29.2 
 
 
248 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3054  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  26.36 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3171  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  26.36 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1189  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.96 
 
 
265 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0156  HpcH/HpaI aldolase family protein  27.48 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1898  HpcH/HpaI aldolase  29.44 
 
 
259 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0359  HpcH/HpaI aldolase family protein  27.48 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2368  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.48 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0320  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.82 
 
 
260 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2345  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.23 
 
 
268 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0175  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.48 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2791  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.48 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2288  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.48 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0164  HpcH/HpaI aldolase family protein  27.48 
 
 
319 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0140  HpcH/HpaI aldolase family protein  27.45 
 
 
261 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108512  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3060  HpcH/HpaI aldolase  31.3 
 
 
244 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388501  normal  0.0341829 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0974  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.18 
 
 
262 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1499  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  27.27 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4276  HpcH/HpaI aldolase  27.84 
 
 
258 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0400534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1881  HpcH/HpaI aldolase  27.75 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1700  HpcH/HpaI aldolase  29.07 
 
 
258 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3223  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.8 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1633  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.17 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09230  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.13 
 
 
301 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380791  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5787  HpcH/HpaI aldolase  33.17 
 
 
264 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0389238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0970  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.51 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  0.0128827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0810  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  27.38 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3463  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.35 
 
 
254 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3132  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  25.97 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0796  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.16 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4135  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.69 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.960195  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0941  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.19 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0046  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.27 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>