More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1325 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  96.73 
 
 		 275 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  86.55 
 
 		 279 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  65.44 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  63.2 
 
 		 286 aa  319  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  61.74 
 
 		 286 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  60.95 
 
 		 276 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  61.68 
 
 		 276 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  60.95 
 
 		 276 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  60.95 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  64.68 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  64.68 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  64.68 
 
 		 286 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  59.04 
 
 		 278 aa  308  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  58.65 
 
 		 278 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  58.18 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  63.7 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  64.07 
 
 		 286 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  62.08 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  56.39 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  55.6 
 
 		 276 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  59.52 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  59.13 
 
 		 274 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  53.01 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  52.85 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  53.91 
 
 		 275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  52.63 
 
 		 280 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  48.72 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  49.42 
 
 		 287 aa  235  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  48.52 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  51.66 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  50 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  52.01 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  47.78 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  50.36 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  49.26 
 
 		 272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  51.29 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  53.73 
 
 		 276 aa  221  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  50.78 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  45.19 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  47.6 
 
 		 275 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  50 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  51.46 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  49.03 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  50 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  44.44 
 
 		 276 aa  202  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  44.74 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  39.56 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.61 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  30.4 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  30.4 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  36.46 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  37.12 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  35.53 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.63 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  28.25 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  35.78 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  35.77 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.23 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  30.07 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  38.61 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  26.29 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  31.38 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  37.8 
 
 		 425 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  34.4 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  31.38 
 
 		 253 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  31.46 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  33.85 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  29.8 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  35.59 
 
 		 253 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  35.27 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  30.83 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  37.24 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  34.48 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  28.05 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  30.53 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  29.88 
 
 		 266 aa  89  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  33.08 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  31.37 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  32.21 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  32.16 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  31.95 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  35.71 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  32.79 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  32.18 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  29.18 
 
 		 312 aa  85.5  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  27.76 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.59 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  29.06 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  29.08 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  29.48 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  32.9 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  33.05 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  32.6 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  28.95 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  34.02 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>