296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4063 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  62.83 
 
 
274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  57.95 
 
 
278 aa  278  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  55.56 
 
 
276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  55.56 
 
 
276 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  55.56 
 
 
276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  55.56 
 
 
276 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  53.96 
 
 
278 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  53.01 
 
 
275 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  59.18 
 
 
278 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  56.06 
 
 
286 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  55.3 
 
 
278 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  53.76 
 
 
275 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  57.47 
 
 
276 aa  250  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  52.79 
 
 
279 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  52.59 
 
 
278 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  55.17 
 
 
279 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  53.9 
 
 
286 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  56.82 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  56.44 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  54.17 
 
 
286 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  53.79 
 
 
286 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  53.79 
 
 
286 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  54.41 
 
 
279 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  53.23 
 
 
279 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  50.4 
 
 
287 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  55.56 
 
 
276 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  50.75 
 
 
275 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  55.3 
 
 
286 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  55.3 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  53.79 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  50.37 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  48.79 
 
 
271 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  47.78 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  45.83 
 
 
274 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  45.32 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  53.64 
 
 
274 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  50.39 
 
 
280 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  50.41 
 
 
276 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  43.18 
 
 
271 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  45.45 
 
 
275 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  49.4 
 
 
288 aa  201  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  44.49 
 
 
272 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  44.87 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  44.81 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  43.77 
 
 
276 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  42.42 
 
 
276 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  42.8 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  29.89 
 
 
274 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.73 
 
 
284 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  29.89 
 
 
274 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  35.42 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  34.2 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.83 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.94 
 
 
294 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  33.46 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  32.97 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  30.31 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  29.23 
 
 
289 aa  108  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.73 
 
 
260 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  29.69 
 
 
266 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  38.82 
 
 
253 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  32.59 
 
 
255 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  33.33 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  29.67 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  36 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  36.33 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  36.4 
 
 
425 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  32.26 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  33.63 
 
 
258 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  30.88 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  37.71 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  31.38 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  31.28 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  37.13 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  32.61 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  33.47 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  34.33 
 
 
289 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  32.02 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  32.62 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  28.87 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  30.51 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  31.95 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  37.65 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  32.62 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  35.27 
 
 
249 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  32 
 
 
254 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  27.43 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  39.91 
 
 
292 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  31.97 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  31.85 
 
 
259 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  39.48 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217793 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  30.22 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  30.43 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  31.56 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  31.14 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  28.57 
 
 
322 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  35.83 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  31.07 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  30.98 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>