More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1626 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  51.29 
 
 
278 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  53.49 
 
 
274 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  59.62 
 
 
274 aa  257  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  49.42 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  50.37 
 
 
278 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  49.21 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  48.65 
 
 
276 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  49.04 
 
 
278 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  46.92 
 
 
276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  46.54 
 
 
276 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  45.28 
 
 
276 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  49.42 
 
 
275 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  50.4 
 
 
267 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  46.74 
 
 
276 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  48.11 
 
 
279 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  47.88 
 
 
275 aa  225  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  46.44 
 
 
278 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  46.8 
 
 
278 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  46.97 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  44.96 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  48.4 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  48.69 
 
 
276 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  47.73 
 
 
286 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  47.73 
 
 
286 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  48 
 
 
274 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  47.35 
 
 
286 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  43.17 
 
 
288 aa  208  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  44.88 
 
 
274 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  45.04 
 
 
276 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  44.09 
 
 
274 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  42.65 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  46.21 
 
 
286 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  41.79 
 
 
276 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  46.97 
 
 
286 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  42.05 
 
 
280 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  44.83 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  40.96 
 
 
275 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.02 
 
 
271 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  41.7 
 
 
276 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  42.91 
 
 
273 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  46.97 
 
 
286 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  41 
 
 
279 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  41.11 
 
 
280 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  40.61 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  41.38 
 
 
279 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.57 
 
 
284 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  38.43 
 
 
276 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  31.6 
 
 
274 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  32.4 
 
 
274 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  34.7 
 
 
271 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  35.51 
 
 
268 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  34.59 
 
 
276 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.15 
 
 
294 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  36.63 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  36.36 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  40 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  28.04 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  36.26 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  34.29 
 
 
256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.08 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  36.02 
 
 
264 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  36.84 
 
 
253 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.27 
 
 
256 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  31.5 
 
 
259 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  26.47 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  29.59 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  29.92 
 
 
258 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  33.48 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  33.72 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  34.06 
 
 
255 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  31.91 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  36.22 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  35.83 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  37.96 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  30.53 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  29.44 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  36.76 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  35.24 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  31.15 
 
 
274 aa  89  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  36.02 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  32.06 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  33.49 
 
 
312 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  29.74 
 
 
274 aa  85.9  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  32.35 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  28.98 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  33.07 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  31.44 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  31.66 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  32.43 
 
 
253 aa  82  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  30.4 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  37.3 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  28.69 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  31.06 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  31.06 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  31.06 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  29.69 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  32.27 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  27.87 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  28.69 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>