More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3644 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  540  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  64.79 
 
 		 274 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  63.3 
 
 		 274 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  66.79 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  65.17 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  60.73 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  52.79 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  59.27 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  60 
 
 		 279 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  54.41 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  52.24 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  50.19 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  53.56 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  52.06 
 
 		 276 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  52.29 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  50 
 
 		 278 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  45.69 
 
 		 278 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  49.64 
 
 		 276 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  50 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  48.87 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  50 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  49.64 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  50.18 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  49.08 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  47.19 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  45.04 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  46.13 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  46.1 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  44.57 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  42.42 
 
 		 267 aa  191  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  43.07 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  46.74 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  46.74 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  46.74 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  43.49 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  44.27 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  46.44 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  48.31 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  44.19 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  45.45 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  44.09 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  38.66 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  47.57 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  48.09 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  44.19 
 
 		 276 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  38.43 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  44.92 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  36.19 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  41.06 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  31.39 
 
 		 284 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  27.63 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  27.24 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  30.24 
 
 		 289 aa  115  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  34.43 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  35.56 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  31.72 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  40.43 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  36.44 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  35.09 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  31.5 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.41 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.86 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  36.84 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.07 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  37.17 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  33.33 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  33.2 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  29.13 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  29.88 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  31.45 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  31.47 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  30 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  38.66 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  34.78 
 
 		 425 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  29.57 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  29.57 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  29.57 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  29.57 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  35.62 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  35.78 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  33.92 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  27.75 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  30.89 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  33.63 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  31.71 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  31.28 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  31.3 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  31.02 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  28.68 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  31.37 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  38.98 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  36.24 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  30.08 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  38.56 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  39.66 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  36.68 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  32.05 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>