289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2201 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  100 
 
 
281 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  53.53 
 
 
278 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  55.72 
 
 
276 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  52.86 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  53.87 
 
 
276 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  56.06 
 
 
286 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  54.48 
 
 
278 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  53.87 
 
 
276 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  54.24 
 
 
276 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  57.63 
 
 
286 aa  245  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  51.66 
 
 
275 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  52.4 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  54.09 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  52.92 
 
 
278 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  50 
 
 
288 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  51.66 
 
 
275 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  48.16 
 
 
274 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  52.57 
 
 
286 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  52.57 
 
 
279 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  50.37 
 
 
267 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  50.55 
 
 
274 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  50.55 
 
 
274 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  52.21 
 
 
286 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  52.21 
 
 
286 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  49.09 
 
 
276 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  53.68 
 
 
286 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  48.91 
 
 
279 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  52.17 
 
 
286 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  50 
 
 
279 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  44.93 
 
 
275 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  51.45 
 
 
286 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  48.19 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  44 
 
 
271 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  44.83 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  43.07 
 
 
274 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  44.04 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  41.76 
 
 
274 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  43.49 
 
 
276 aa  178  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  45.14 
 
 
280 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  47.81 
 
 
274 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.75 
 
 
271 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  44.57 
 
 
276 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  43.17 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  43.01 
 
 
273 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  43.48 
 
 
276 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  37.68 
 
 
268 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  40.17 
 
 
271 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  41.39 
 
 
276 aa  148  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  40.22 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.73 
 
 
284 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  31.62 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  33.2 
 
 
274 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  37.96 
 
 
276 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.8 
 
 
294 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  36.17 
 
 
256 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  40.61 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.3 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  34.78 
 
 
258 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  35.74 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  30.07 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  37.28 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  31.72 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  33.19 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  40.69 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  28.57 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  33.98 
 
 
258 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  38.98 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  33.09 
 
 
265 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  36.4 
 
 
255 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  36.12 
 
 
258 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  34.65 
 
 
253 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  36.78 
 
 
274 aa  99  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  34.11 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  38.19 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  35.95 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.19 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  37.28 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  37.45 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.83 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  35.71 
 
 
258 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  35.68 
 
 
252 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  31.74 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  35.68 
 
 
252 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  35.68 
 
 
252 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  34.55 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  37.76 
 
 
253 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  35.42 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  35.27 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  33.04 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  33.04 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  32 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  36.82 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  37.97 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  38.03 
 
 
253 aa  89  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  32.09 
 
 
274 aa  89  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  37.39 
 
 
253 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  31.6 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  36.09 
 
 
425 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>