241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3426 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  557  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  51.99 
 
 		 266 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  55.07 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  53.19 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  53.62 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  48.53 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  53.74 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  47.09 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  40.17 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  38.86 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  45.64 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  38.17 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  33.46 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  38.56 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  41.12 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.1 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  35.19 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  36.28 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  38.08 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  35.84 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  32.58 
 
 		 274 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.8 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  33.2 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.02 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.51 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  39.21 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  36.82 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  34.3 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  36.87 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  34.5 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.27 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  38.33 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  34.58 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  34.17 
 
 		 253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.89 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  33.33 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  32.2 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  36.32 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  32.64 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  31.28 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  32.08 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  31.56 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  32.31 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  33.04 
 
 		 425 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  31.23 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  31.14 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.09 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  31.88 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  33.75 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.36 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  32.49 
 
 		 258 aa  95.5  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  31.74 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  35 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  29.96 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  32.6 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  30.57 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  30.97 
 
 		 252 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  30.97 
 
 		 252 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  30.97 
 
 		 252 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  30.09 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  31.49 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  31.49 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  30.53 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  32.31 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  30.73 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.49 
 
 		 276 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  35.68 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  30.73 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  30.73 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  32.89 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  30.4 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  30 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  30.4 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  29.96 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  27.63 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  29.82 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  31.88 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  32.93 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  32.14 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  28.76 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  30.88 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1447  PEP phosphonomutase and related enzymes  32.75 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  33.19 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  29.2 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  31.03 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  29.96 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  33.89 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  31.17 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  32.72 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  30.26 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  26.99 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.04 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  31.94 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  28.85 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  28.63 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  30.6 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  30.53 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  30.28 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  27.23 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>