More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5224 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  65.44 
 
 		 275 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  66.18 
 
 		 275 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  66.18 
 
 		 279 aa  329  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  65.15 
 
 		 286 aa  324  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  61.68 
 
 		 276 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  61.68 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  62.04 
 
 		 276 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  64.1 
 
 		 286 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  60.95 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  57.35 
 
 		 278 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  61.6 
 
 		 278 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  64.73 
 
 		 286 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  64.36 
 
 		 286 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  64.36 
 
 		 286 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  57.46 
 
 		 278 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  65.33 
 
 		 286 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  65.45 
 
 		 286 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  55.88 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  59.18 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  65.56 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  57.79 
 
 		 276 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  58.39 
 
 		 274 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  58.03 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  55.85 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  50.92 
 
 		 271 aa  258  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  51.47 
 
 		 274 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  50.37 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  54.78 
 
 		 279 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  49.8 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  53.54 
 
 		 275 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  50.19 
 
 		 274 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  50.72 
 
 		 280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  52.92 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  50.55 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  55.26 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  52.99 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  54.04 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  53.73 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  52.94 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  49.82 
 
 		 273 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  48.34 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  46.32 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  48.88 
 
 		 276 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  50.91 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  45.45 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  46.82 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  42.32 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  33.08 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  32.7 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.85 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  36.46 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  38.87 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.75 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  35.38 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  28.73 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.64 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  30.92 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  35.42 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  38.63 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  36.96 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  31.48 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  34.83 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  37.59 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  35.98 
 
 		 256 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  34.68 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  34.68 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  32.6 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  34.68 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.77 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  39.92 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  34.27 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  34.68 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  33.72 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  33.93 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  39.47 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  34.58 
 
 		 425 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  36.68 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  33.2 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.75 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  35.44 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  34.63 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  38.7 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  32.53 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  38.14 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  38.33 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  32.75 
 
 		 269 aa  95.5  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  28.36 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  34.11 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  33.99 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  35.16 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  33.46 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  31.54 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  33.46 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  33.46 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  33.46 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  32.44 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  38.24 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  31.4 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>