More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6009 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  85 
 
 		 280 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  57.72 
 
 		 274 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  58.46 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  55.68 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  60.51 
 
 		 279 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  61.85 
 
 		 276 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  57.46 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  53.85 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  58.09 
 
 		 273 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  57.41 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  59.78 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  56.72 
 
 		 275 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  59.35 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  52.63 
 
 		 286 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  54.18 
 
 		 276 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  53.09 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  53.45 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  52.63 
 
 		 275 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  54.18 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  52.36 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  50.92 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  54.41 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  52.26 
 
 		 275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  50.9 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  53.96 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  50.58 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  50.72 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  49.25 
 
 		 274 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  47.78 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  48.91 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  49.28 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  51.27 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  51.27 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  51.27 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  47.1 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  52.36 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  50.91 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  48.06 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  51.88 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  44.28 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  42.05 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  46.62 
 
 		 276 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  46.72 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  45.85 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  43.91 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  31.65 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  31.41 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  39.62 
 
 		 288 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  40.68 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.21 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  39.86 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  38.85 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  35.74 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  41.67 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  36.33 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.04 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  37.46 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  28.03 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  37.76 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  42.06 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.82 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  27.88 
 
 		 289 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  33.82 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  32.41 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.09 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  36.7 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  33.47 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  34.35 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  27.94 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  34.47 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.21 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  29.39 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  34.18 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  31.45 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  34.05 
 
 		 282 aa  99  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  34.05 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  32.71 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  33.62 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  34.45 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  37.6 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  35.93 
 
 		 425 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  36.07 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  42.42 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  34.04 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  36.6 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  34.65 
 
 		 258 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  34.43 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  34.43 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  34.43 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  30.43 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  28.32 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  30.5 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  32.2 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  38.33 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  30.4 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  31.67 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  35.69 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  36.78 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  28.03 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>