More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2645 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  100 
 
 
295 aa  558  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  60.71 
 
 
425 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  58.98 
 
 
264 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  54.13 
 
 
255 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  50.76 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  53.1 
 
 
258 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  44.58 
 
 
258 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  36.28 
 
 
266 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  33.84 
 
 
274 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  36.4 
 
 
274 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  38.75 
 
 
284 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2418  hypothetical protein  47.58 
 
 
242 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  44.44 
 
 
278 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  36.09 
 
 
258 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  40.33 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  38.87 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  41.89 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  39.11 
 
 
256 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  40.26 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  41.1 
 
 
282 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  40.26 
 
 
282 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  40.89 
 
 
253 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  40.69 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  40.26 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  29.92 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  42.69 
 
 
253 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  39.92 
 
 
268 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  38.46 
 
 
264 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  38.33 
 
 
269 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  46.33 
 
 
289 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  40.08 
 
 
249 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  36.44 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  42.21 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  39.77 
 
 
276 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  40.15 
 
 
276 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  38.49 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  35.63 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  42.36 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  36.82 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  40.96 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.42 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  39.59 
 
 
253 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  37.08 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  40.08 
 
 
278 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  37.5 
 
 
272 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  37.2 
 
 
275 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.78 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.43 
 
 
276 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  38.11 
 
 
278 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  35.8 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  35.34 
 
 
278 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  43.16 
 
 
271 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  36.78 
 
 
276 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  33.46 
 
 
271 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  40.77 
 
 
254 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.41 
 
 
274 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  36.21 
 
 
274 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  38.2 
 
 
279 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  35.71 
 
 
273 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  38.34 
 
 
260 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  35.74 
 
 
275 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  39.06 
 
 
286 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  37.76 
 
 
276 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  35.95 
 
 
287 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  37.45 
 
 
275 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  35.8 
 
 
274 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  38.02 
 
 
279 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.59 
 
 
294 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  36.61 
 
 
269 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  34.6 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  37.76 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  39.34 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  34.63 
 
 
281 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  39.24 
 
 
253 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  38.93 
 
 
255 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  41.87 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  35.1 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  39.09 
 
 
279 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  37.5 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  40.08 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.34 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  37.75 
 
 
253 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  37 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  36.12 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  36.47 
 
 
274 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  36.12 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  35.74 
 
 
267 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  35.42 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  36.47 
 
 
274 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  35.09 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  33.17 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  38.52 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  33.92 
 
 
279 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  37.5 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  33.66 
 
 
302 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.62358 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  30.4 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  33.66 
 
 
302 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.66 
 
 
302 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  36 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  36 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>