More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1074 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  100 
 
 		 278 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  66.91 
 
 		 276 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  66.54 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  66.17 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  65.43 
 
 		 276 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  63.02 
 
 		 286 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  61.48 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  58.65 
 
 		 275 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  60.37 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  59.63 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  59.02 
 
 		 275 aa  294  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  59.93 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  58.43 
 
 		 286 aa  285  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  59.19 
 
 		 286 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  59.19 
 
 		 286 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  58.65 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  57.46 
 
 		 278 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  54.85 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  60.45 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  53.96 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  54.2 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  51.49 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  58.21 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  53.53 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  53.73 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  56.64 
 
 		 278 aa  248  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  49.08 
 
 		 274 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  53.36 
 
 		 275 aa  245  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  57.46 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  47.94 
 
 		 271 aa  241  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  48.34 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  52.47 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  50.92 
 
 		 280 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  54.38 
 
 		 276 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  50.38 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  51.85 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  48.21 
 
 		 271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  51.33 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  47.21 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  49.26 
 
 		 276 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  49.81 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  47.21 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  47.94 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  46.44 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  45.69 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  50.75 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  47.01 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  41.6 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  37.41 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.48 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  29.81 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  35.79 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  30.4 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  29.23 
 
 		 274 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.07 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  39.39 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  33.7 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  34.63 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  31.23 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  34.76 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  25.83 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  36.73 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  33.48 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.77 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.02 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  34.15 
 
 		 253 aa  99.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  36.59 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  31.46 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  33.95 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  32.68 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  31.34 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  37.34 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  31.88 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  32.4 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  39.5 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  33.06 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  32.34 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  32.44 
 
 		 255 aa  93.6  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  35.04 
 
 		 425 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  32.14 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  32.33 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  31.95 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  37.96 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  37.87 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  31.97 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  31.58 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  37.64 
 
 		 289 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  37.45 
 
 		 255 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  31.54 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  38.43 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2418  hypothetical protein  36.36 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.59 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  33.09 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.71 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  31.78 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  31.15 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  34.04 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  31.97 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  31.75 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  31.75 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>