226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4524 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  65.91 
 
 		 265 aa  338  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  64.39 
 
 		 273 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  47.84 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  44.94 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  41.89 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  41.57 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  33.84 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  40.71 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  40.97 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  34.39 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  39.03 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  38.26 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  38.96 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  39.48 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  36.73 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.8 
 
 		 294 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  34.5 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  36.4 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.42 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  41.12 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  40.46 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.73 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  29.74 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  35.43 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  38.24 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  38.25 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  37.82 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  37.95 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  33.73 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  37.05 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  36.33 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.02 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  33.46 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  31.62 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  30.97 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  33.09 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  37.82 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  40.27 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  37.9 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  32.71 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  39.11 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  36.73 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.8 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  31.6 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  35.14 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  31.72 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  31.23 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  32.09 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  34.85 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  31.4 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  34.51 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  33.82 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  34.51 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  34.51 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  32 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  30.31 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  33.75 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  37.78 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  39.3 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  35.27 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  31.48 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  31.76 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  32.37 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  31.38 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  31.35 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  32.1 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  29.53 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  30.74 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.84 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  35.98 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.1 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  35.98 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.1 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  31.72 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  39.82 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  39.11 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  34.55 
 
 		 258 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.99 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  31.56 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  38.39 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  27.78 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  31.42 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  31.56 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  29.89 
 
 		 278 aa  92.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  31.37 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  29.92 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  34.66 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  36.61 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  29.8 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1447  PEP phosphonomutase and related enzymes  33.33 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  33 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  31.17 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  30.97 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  33.63 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  33.04 
 
 		 425 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>