More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3097 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  40.08 
 
 
256 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  45.53 
 
 
273 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  38.49 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  44.26 
 
 
253 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  35.36 
 
 
274 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  35.5 
 
 
274 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  36.51 
 
 
258 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  37.6 
 
 
289 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  39.02 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  35.25 
 
 
284 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  38.93 
 
 
254 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  39.43 
 
 
273 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  38.37 
 
 
258 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  35.42 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  39.37 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  39.59 
 
 
253 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  39.59 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  38.33 
 
 
265 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.49 
 
 
260 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  40.35 
 
 
264 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  33.73 
 
 
266 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  34.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  37.5 
 
 
259 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  37.19 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  39.06 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  35.69 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  39.82 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  38.21 
 
 
282 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  37.45 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  37.45 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  38.37 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  37.45 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  37.6 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  37.08 
 
 
252 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  36.59 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  37.8 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  36.99 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.71 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  39.26 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1447  PEP phosphonomutase and related enzymes  37.6 
 
 
249 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  36.51 
 
 
253 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  39.75 
 
 
289 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  36.68 
 
 
279 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  36.14 
 
 
253 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  35.62 
 
 
255 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  38.25 
 
 
425 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  33.82 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  33.72 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  37.61 
 
 
266 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  33.98 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  35.48 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  35.5 
 
 
276 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  33.72 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  34.51 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  35.48 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  30.92 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  41.02 
 
 
264 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  35.91 
 
 
278 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  34.62 
 
 
253 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  33.46 
 
 
286 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.5 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  35.91 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  35.5 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  36.68 
 
 
279 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  36.4 
 
 
276 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  34.25 
 
 
275 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.35 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  36.02 
 
 
276 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  34.73 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  34.4 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  33.87 
 
 
276 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  36.11 
 
 
274 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  32.81 
 
 
286 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.86 
 
 
271 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  31.2 
 
 
272 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  35.59 
 
 
279 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.87 
 
 
276 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  33.72 
 
 
286 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  32.4 
 
 
278 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  34.11 
 
 
281 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  32.03 
 
 
280 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  31.62 
 
 
274 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  35.43 
 
 
258 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  30.62 
 
 
278 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  33.85 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  33.2 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  31.3 
 
 
258 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  33.98 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  30.28 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  33.59 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  29.62 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  32.43 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  32.82 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  31.97 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  36.1 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  31.42 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  33.07 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>