More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5102 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5102  putative alcohol dehydrogenase  100 
 
 
358 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525814  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1730  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.44 
 
 
366 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2808  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.62 
 
 
359 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4742  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.53 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3424  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4093  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
359 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1348  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.43 
 
 
374 aa  136  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000439495  decreased coverage  0.00000156637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4528  putative alcohol dehydrogenase, zinc-dependent  34.12 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.860394  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3018  alcohol dehydrogenase  28.25 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.26 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4136  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137043  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3662  alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.25 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.61 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.75 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  27.91 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.59 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.19 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.32 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4382  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5063  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.65 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392538  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5797  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202299  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.67 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.21 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  26.48 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.28 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.51 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3068  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.53 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.86 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  26.12 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  26.16 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.66 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.94 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.74 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0584  alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.07 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5053  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.82 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.19 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  25.68 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.56 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.94 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.94 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2883  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.13 
 
 
383 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.64 
 
 
323 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.39 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.38 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.39 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0196  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.11 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  24.93 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.03 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1176  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.5 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  25.18 
 
 
340 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.13 
 
 
336 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.41 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  26.2 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.44 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  26.08 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  27.33 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3732  alcohol dehydrogenase  26.78 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.564534  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0075  sorbitol dehydrogenase, putative  24.11 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.57 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.87 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  24.48 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  23.94 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.08 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  25.41 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  26.12 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.52 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1742  D-xylulose reductase  26.94 
 
 
344 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.247806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  25.18 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.6 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.7 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.1 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>