More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2808 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2808  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
359 aa  727    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4093  alcohol dehydrogenase  65.55 
 
 
359 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4742  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.27 
 
 
359 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3424  alcohol dehydrogenase  65.27 
 
 
359 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4528  putative alcohol dehydrogenase, zinc-dependent  61.17 
 
 
359 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.860394  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1730  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.98 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5102  putative alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
358 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525814  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1348  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.42 
 
 
374 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000439495  decreased coverage  0.00000156637 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
361 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3018  alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.05 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  28.66 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5230  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.6 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  0.793838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5498  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.17 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.12 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.03 
 
 
340 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1426  putative alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.967843  normal  0.34363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2059  alcohol dehydrogenase  27.33 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.45 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  28.99 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.01 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  27.01 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  28.02 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0396  alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.88 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  27.71 
 
 
341 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  26.35 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 
325 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.35 
 
 
318 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  28.47 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.87 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  25.48 
 
 
344 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.62 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.72 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  26.72 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.21 
 
 
325 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  27 
 
 
342 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  27.73 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  27.54 
 
 
325 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
332 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.35 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  26.38 
 
 
327 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.72 
 
 
325 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 
317 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.23 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.72 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.94 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.63 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.9 
 
 
639 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.57 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.54 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.48 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.78 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  28.98 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.2 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.79 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.2 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  25.89 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.2 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.2 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.2 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.57 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.17 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.2 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.82 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  26.73 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  25.16 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  29.96 
 
 
342 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.66 
 
 
335 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  24.84 
 
 
319 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.25 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  23.53 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.02 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04630  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  28.45 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.61 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.44 
 
 
350 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  24.56 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  24.73 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  26.46 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  23.8 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>