More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3018 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3018  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  767    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1348  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.12 
 
 
374 aa  359  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000439495  decreased coverage  0.00000156637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.33 
 
 
368 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5102  putative alcohol dehydrogenase  28.25 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525814  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0345  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.59 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1730  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.14 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
344 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.73 
 
 
351 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.73 
 
 
353 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
349 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.53 
 
 
341 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  29.57 
 
 
352 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  26.1 
 
 
369 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
373 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.46 
 
 
365 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.48 
 
 
373 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
373 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
373 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
349 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  25.93 
 
 
355 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
365 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.86 
 
 
354 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  27.07 
 
 
353 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.01 
 
 
351 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
354 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
373 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.54 
 
 
344 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.67 
 
 
346 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
329 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
329 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
329 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.18 
 
 
373 aa  99.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  28.42 
 
 
361 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.95 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.1 
 
 
347 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.24 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.64 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  27.97 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.27 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.98 
 
 
361 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.36 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  27.3 
 
 
359 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
360 aa  95.9  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.52 
 
 
346 aa  96.3  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  27.24 
 
 
364 aa  96.3  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.52 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5668  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.03 
 
 
339 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1066  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.38 
 
 
339 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743833  normal  0.0804762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.53 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  24.55 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  28.13 
 
 
361 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  24.87 
 
 
372 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  27.42 
 
 
349 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.65 
 
 
350 aa  93.2  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.48 
 
 
340 aa  93.2  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.87 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  24.86 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.77 
 
 
369 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  23.42 
 
 
376 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.14 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  27.97 
 
 
353 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.29 
 
 
346 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.04 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.2 
 
 
346 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  24.61 
 
 
376 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.55 
 
 
355 aa  90.5  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
351 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.35 
 
 
374 aa  89.7  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  26.72 
 
 
335 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  26.61 
 
 
336 aa  89.7  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  26.58 
 
 
365 aa  89.4  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 
350 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
346 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.54 
 
 
345 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  24.04 
 
 
370 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02510  alcohol dehydrogenase, putative  31.65 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.886451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
344 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.9 
 
 
359 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.66 
 
 
372 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  22.91 
 
 
376 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
373 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.43 
 
 
333 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  24.54 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  22.91 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  22.91 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  24.35 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  23.45 
 
 
385 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  26.3 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  22.91 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2723  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0619136  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.85 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  25.99 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>