More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1730 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1730  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
366 aa  738    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4742  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.15 
 
 
359 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3424  alcohol dehydrogenase  55.15 
 
 
359 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4093  alcohol dehydrogenase  54.6 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2808  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.98 
 
 
359 aa  342  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4528  putative alcohol dehydrogenase, zinc-dependent  56.27 
 
 
359 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.860394  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5102  putative alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
358 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525814  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3018  alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1348  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.1 
 
 
374 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000439495  decreased coverage  0.00000156637 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  26.2 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1391  alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.487045 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.54 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  30.46 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  27.46 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.31 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  31.97 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.86 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  28.02 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  27.12 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.12 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.39 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.99 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.62 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.42 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  24.18 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00942  hypothetical protein similar to L-arabitol dehydrogenase (Eurofung)  26.59 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  27.5 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.38 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.39 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  24.27 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.63 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.93 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  33.49 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  25.15 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.88 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.1 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.01 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.2 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.51 
 
 
317 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.62 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2879  alcohol dehydrogenase  26.58 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0472393  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.49 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  25.88 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.69 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.34 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903746  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.62 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  28.81 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  26.99 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.16 
 
 
342 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  31.43 
 
 
325 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.01 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  31 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1454  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.73 
 
 
371 aa  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.44 
 
 
344 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.79 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.44 
 
 
344 aa  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
342 aa  63.5  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.07 
 
 
336 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.93 
 
 
336 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.11 
 
 
353 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  26.78 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  27.42 
 
 
381 aa  63.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.81 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.71 
 
 
341 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  24.59 
 
 
400 aa  63.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.71 
 
 
341 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  26.94 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.61 
 
 
357 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1915  alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.01 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.01 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0499  alcohol dehydrogenase  23.35 
 
 
367 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00895021  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.01 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.21 
 
 
342 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>