More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3424 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4742  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
359 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4093  alcohol dehydrogenase  98.61 
 
 
359 aa  707    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3424  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
359 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2808  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.27 
 
 
359 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4528  putative alcohol dehydrogenase, zinc-dependent  68.8 
 
 
359 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.860394  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1730  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.15 
 
 
366 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5102  putative alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
358 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525814  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1348  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.93 
 
 
374 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000439495  decreased coverage  0.00000156637 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  26.11 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3018  alcohol dehydrogenase  25.46 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.88 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.54 
 
 
336 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.58 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  27.97 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  26.45 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  27 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1426  putative alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.967843  normal  0.34363 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  22.91 
 
 
639 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.91 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.2 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  26.2 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  26.2 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  25.81 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.87 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  28.38 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  21.52 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.09 
 
 
342 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  30.24 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  25.56 
 
 
325 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  27.54 
 
 
325 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.88 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.91 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  26.96 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.96 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.96 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.95 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.96 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.82 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.96 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.96 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.96 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.24 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.73 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.87 
 
 
317 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.3 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  26.45 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.07 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.64 
 
 
329 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
362 aa  60.5  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
344 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.19 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7506  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.79 
 
 
369 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  29.8 
 
 
341 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
361 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
342 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.53 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  27.23 
 
 
347 aa  59.7  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1718  alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.74 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.49 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1971  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.17 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.05 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.56 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  27.75 
 
 
357 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0905  alcohol dehydrogenase  25.77 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.586977  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.74 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.21 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.21 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  25.21 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.1 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.21 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  23.92 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  27.3 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5053  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.62 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  28.7 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  27.24 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.35 
 
 
317 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.17 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
344 aa  56.6  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  28.99 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  40.23 
 
 
324 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.34 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 
344 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  23.36 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.78 
 
 
309 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 
317 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>