More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4528 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4528  putative alcohol dehydrogenase, zinc-dependent  100 
 
 
359 aa  722    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.860394  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4742  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  68.8 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3424  alcohol dehydrogenase  68.8 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4093  alcohol dehydrogenase  68.52 
 
 
359 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2808  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.17 
 
 
359 aa  418  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1730  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.27 
 
 
366 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5102  putative alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525814  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1348  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.53 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000439495  decreased coverage  0.00000156637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3018  alcohol dehydrogenase  26.04 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  28.29 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5498  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.17 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.3 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5230  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.86 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  0.793838 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.3 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  23.38 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  26.37 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.3 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.74 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.43 
 
 
639 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.16 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.8 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  32.35 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04630  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  27.05 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2059  alcohol dehydrogenase  27.19 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.5 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.49 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  28.67 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.86 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.52 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.94 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  31.86 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2879  alcohol dehydrogenase  26.49 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0472393  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
324 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.5 
 
 
327 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.42 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.04 
 
 
341 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  27.5 
 
 
327 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.39 
 
 
341 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
340 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  26.71 
 
 
347 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  26.71 
 
 
347 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.3 
 
 
328 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.72 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.7 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.16 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  27.16 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  26.79 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  27.16 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  28.16 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.82 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
342 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.44 
 
 
357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.23 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
325 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
345 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.44 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.44 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
325 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.44 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.44 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.44 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  26.54 
 
 
324 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
342 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.63 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.27 
 
 
326 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  24.72 
 
 
349 aa  59.3  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  23.96 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.22 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.03 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.39 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.99 
 
 
314 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.75 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  26.32 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4136  alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137043  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  23.49 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>