117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3354 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3354  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 209 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0139  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.32 
 
 		 591 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0043  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.96 
 
 		 520 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3723  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.47 
 
 		 544 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.876202  normal  0.78493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0119  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.57 
 
 		 489 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3614  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.9 
 
 		 503 aa  115  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1770  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.42 
 
 		 522 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00425829  normal  0.115514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.27 
 
 		 504 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.65 
 
 		 570 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0309  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.45 
 
 		 569 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0536  putative cytidine deaminase  45.52 
 
 		 522 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236376  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1865  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.28 
 
 		 488 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.58 
 
 		 153 aa  62  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 		 151 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  37.5 
 
 		 151 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.13 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.13 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.13 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  44.78 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.68 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  41.54 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.14 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  38.46 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.37 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0732  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 		 609 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  36.23 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.89 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.79 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  42.03 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.13 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.68 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.4 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.26 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.58 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.83 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  41.38 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.43 
 
 		 166 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  40 
 
 		 125 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  47.27 
 
 		 160 aa  53.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.67 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.73 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.26 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.26 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.23 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.23 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.71 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.13 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.23 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  43.64 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  39.39 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  38.89 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  38.89 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  37.31 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.86 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.92 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  37.93 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.89 
 
 		 135 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.23 
 
 		 154 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  37.04 
 
 		 153 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  43.86 
 
 		 173 aa  48.5  0.00007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  39.62 
 
 		 156 aa  48.5  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.38 
 
 		 146 aa  48.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.1 
 
 		 161 aa  48.1  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.78 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.23 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  35.19 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  40.74 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  40.74 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  40.3 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.51 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  38.89 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  41.27 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.1 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  36.51 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  39.68 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  38.89 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  38.89 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  38.89 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  38.89 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  38.89 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  44.44 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  38.89 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  38.89 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.43 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  34.33 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  34.33 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.7 
 
 		 169 aa  45.1  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3746  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.59 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.28 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05385  deoxycytidylate deaminase  38.98 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000505  deoxycytidylate deaminase  38.98 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  41.51 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0395  putative deoxycytidylate deaminase  39.66 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.94 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.54 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.94 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>