More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1134 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  100 
 
 
166 aa  343  7e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  96.99 
 
 
166 aa  333  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.03 
 
 
164 aa  223  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9348  predicted protein  59.59 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  59.49 
 
 
159 aa  192  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  56.46 
 
 
157 aa  184  6e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  58.4 
 
 
125 aa  162  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  47.37 
 
 
156 aa  159  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  55.71 
 
 
153 aa  159  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  41.67 
 
 
187 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  41.67 
 
 
187 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  42.36 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3945  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.78 
 
 
145 aa  95.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05385  deoxycytidylate deaminase  40.13 
 
 
168 aa  94.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000505  deoxycytidylate deaminase  39.35 
 
 
154 aa  94.4  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0395  putative deoxycytidylate deaminase  37.91 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3277  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.1 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3657  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.55 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.24 
 
 
149 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0956  putative cytidine and deoxycytidylate deaminase  36.77 
 
 
147 aa  91.3  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3571  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.73 
 
 
144 aa  90.9  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0078  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.42 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.91 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.66 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.1 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.49 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  37.58 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  37.58 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  37.58 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  37.58 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  37.58 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  37.58 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  39.39 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  37.58 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  37.41 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  37.41 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  38.64 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.42 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.42 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.19 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.78 
 
 
147 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  35.57 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  36.24 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  37.6 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  36.62 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.19 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.68 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.88 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  39.72 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.3 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  33.76 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.57 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.48 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.25 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  34.46 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.46 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3746  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.78 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.25 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.1 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  33.1 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.9 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.3 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  34.84 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  40.16 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.61 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.48 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  37.61 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.51 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  36.36 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  35.82 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.43 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  32.05 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  34.59 
 
 
161 aa  72  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.78 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.64 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  33.97 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.82 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.9 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  34.38 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.48 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.03 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.78 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.89 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  35.43 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  28.3 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.56 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.11 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.86 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  32.86 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.57 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  36.22 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.87 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.25 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.86 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.2 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.45 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>