261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0644 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  100 
 
 
161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  64.38 
 
 
153 aa  211  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  64.34 
 
 
185 aa  208  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  63.19 
 
 
156 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  61.81 
 
 
151 aa  205  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  62.94 
 
 
185 aa  203  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  62.24 
 
 
185 aa  202  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  62.24 
 
 
185 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  62.24 
 
 
185 aa  202  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  62.24 
 
 
185 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  62.24 
 
 
185 aa  201  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  62.24 
 
 
185 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  62.16 
 
 
185 aa  201  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  59.87 
 
 
185 aa  200  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  60.81 
 
 
185 aa  198  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  65.67 
 
 
143 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  65.67 
 
 
143 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  54.25 
 
 
158 aa  191  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.22 
 
 
151 aa  187  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  57.32 
 
 
162 aa  186  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  54.36 
 
 
154 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  55.15 
 
 
150 aa  166  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  54.68 
 
 
151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.03 
 
 
148 aa  158  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.59 
 
 
135 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.48 
 
 
164 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 
164 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  43.06 
 
 
164 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 
164 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  49.24 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  43.24 
 
 
173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.23 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  48.06 
 
 
146 aa  123  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.72 
 
 
155 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  42.67 
 
 
156 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.16 
 
 
152 aa  122  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.67 
 
 
174 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.86 
 
 
162 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.52 
 
 
158 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.84 
 
 
154 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.72 
 
 
177 aa  120  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  42.07 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.33 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.22 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  41.03 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.07 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  41.06 
 
 
187 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.39 
 
 
169 aa  117  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  41.78 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.33 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.1 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.95 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.61 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.57 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  45.07 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.22 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.26 
 
 
150 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.11 
 
 
153 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.8 
 
 
156 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.56 
 
 
153 aa  114  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5014  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.68 
 
 
194 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
155 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.38 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.18 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.96 
 
 
155 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.25 
 
 
176 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  38.99 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.36 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.17 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.31 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.73 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.47 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.97 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  39.35 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2084  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.76 
 
 
180 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294047  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  41.35 
 
 
159 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  38.41 
 
 
273 aa  104  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1242  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.38 
 
 
179 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.1 
 
 
151 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.96 
 
 
200 aa  101  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.22 
 
 
157 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.46 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  40.46 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  37.33 
 
 
341 aa  95.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  42.86 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.09 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.59 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.65 
 
 
186 aa  91.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  41.46 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.27 
 
 
151 aa  89  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.04 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.84 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.49 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.87 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.72 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1856  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.56 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>