197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3945 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3945  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
145 aa  306  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3277  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  95.8 
 
 
144 aa  292  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3657  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  93.01 
 
 
145 aa  286  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  92.31 
 
 
149 aa  285  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3571  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  90.21 
 
 
144 aa  279  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000505  deoxycytidylate deaminase  80.14 
 
 
154 aa  252  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05385  deoxycytidylate deaminase  76.55 
 
 
168 aa  251  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0395  putative deoxycytidylate deaminase  80.85 
 
 
166 aa  249  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0078  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  80.14 
 
 
147 aa  244  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0956  putative cytidine and deoxycytidylate deaminase  76.6 
 
 
147 aa  241  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 
159 aa  107  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.1 
 
 
164 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3412  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
144 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234898  hitchhiker  0.00117698 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.14 
 
 
166 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.78 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  34.93 
 
 
157 aa  92  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  43.24 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3746  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.06 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.55 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9348  predicted protein  37.06 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  39.13 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.13 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  38.94 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.61 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  33.33 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  39.29 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.89 
 
 
168 aa  76.6  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.86 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  32 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.15 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  31.76 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  29.61 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  31.65 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.13 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.23 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  30.14 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  37.39 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.57 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.8 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.83 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.14 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.83 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.14 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.73 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.87 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.07 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.25 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  33.1 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  33.1 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.17 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  29.05 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  33.1 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  37.39 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  37.39 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  37.39 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  37.39 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  37.39 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  37.39 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  37.39 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  37.39 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  37.39 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  35.09 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  29.05 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.05 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.67 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.3 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.5 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  35.09 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  35.14 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.33 
 
 
182 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.59 
 
 
159 aa  70.1  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  32.89 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  28.1 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.13 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.66 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.45 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  33.85 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.15 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  33.61 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  38.74 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1856  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.06 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.71 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.73 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.33 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.58 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.1 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.78 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  33.33 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  33.33 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.94 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.25 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.53 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  26.52 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.8 
 
 
177 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  30.33 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.67 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.41 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.41 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.61 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.83 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>