174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1618 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
158 aa  328  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.61 
 
 
176 aa  254  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.26 
 
 
182 aa  248  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  71.43 
 
 
155 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.67 
 
 
153 aa  231  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.49 
 
 
153 aa  229  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  70.55 
 
 
154 aa  221  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  70.55 
 
 
154 aa  220  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  65.19 
 
 
156 aa  217  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.24 
 
 
151 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  64.24 
 
 
151 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  63.33 
 
 
156 aa  208  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.73 
 
 
155 aa  207  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.26 
 
 
156 aa  206  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  64.34 
 
 
147 aa  205  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.38 
 
 
152 aa  203  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  63.95 
 
 
158 aa  203  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  62.33 
 
 
161 aa  201  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.38 
 
 
148 aa  201  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.19 
 
 
155 aa  196  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.33 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.43 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.5 
 
 
145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.38 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.56 
 
 
162 aa  190  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.95 
 
 
154 aa  187  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  55.1 
 
 
159 aa  185  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  57.04 
 
 
156 aa  181  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.9 
 
 
144 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.17 
 
 
157 aa  177  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  58.17 
 
 
157 aa  177  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52 
 
 
151 aa  173  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56 
 
 
157 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.04 
 
 
149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.82 
 
 
170 aa  170  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.94 
 
 
159 aa  169  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.48 
 
 
169 aa  169  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
169 aa  161  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  53.38 
 
 
157 aa  161  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
169 aa  161  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.81 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.62 
 
 
174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.92 
 
 
173 aa  143  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  48.95 
 
 
187 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.25 
 
 
174 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  48.25 
 
 
173 aa  140  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.89 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.95 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  43.23 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  45.21 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  45.58 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.4 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.83 
 
 
164 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  41.94 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.42 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  42.95 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.95 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.95 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  42.47 
 
 
162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.41 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  44.52 
 
 
143 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  44.52 
 
 
143 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  43.75 
 
 
156 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  40.82 
 
 
185 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  40.52 
 
 
161 aa  120  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  38.12 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.44 
 
 
200 aa  118  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  41.55 
 
 
273 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.52 
 
 
135 aa  117  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  38.78 
 
 
185 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  42.18 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  41.06 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.22 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.79 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131735  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  36.73 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.22 
 
 
148 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.44 
 
 
185 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  42.15 
 
 
146 aa  103  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.31 
 
 
145 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1242  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.65 
 
 
179 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
151 aa  100  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2084  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.44 
 
 
180 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294047  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.26 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0885  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.24 
 
 
173 aa  97.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0241026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34 
 
 
186 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5014  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.27 
 
 
194 aa  95.5  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0189  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.62 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.51 
 
 
143 aa  91.3  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  33.12 
 
 
160 aa  90.9  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
164 aa  90.5  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  30.63 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1248  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.96 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.639553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>