190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0992 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
151 aa  313  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  74.5 
 
 
186 aa  239  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.59 
 
 
164 aa  228  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  68.21 
 
 
159 aa  226  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  62.84 
 
 
160 aa  207  5e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.72 
 
 
144 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.46 
 
 
148 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.4 
 
 
168 aa  114  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.48 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  40.4 
 
 
158 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.35 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  39.35 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  38.56 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.66 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.06 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.09 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.48 
 
 
156 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  37.09 
 
 
156 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.35 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  41.6 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  36.36 
 
 
156 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.95 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.13 
 
 
154 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.76 
 
 
152 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  41.54 
 
 
154 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.06 
 
 
151 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.42 
 
 
145 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.84 
 
 
157 aa  104  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.84 
 
 
157 aa  104  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  36.84 
 
 
157 aa  104  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.84 
 
 
155 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.56 
 
 
149 aa  104  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.06 
 
 
169 aa  103  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.06 
 
 
169 aa  103  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.44 
 
 
146 aa  102  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.16 
 
 
170 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.6 
 
 
155 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
158 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.26 
 
 
164 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  38.26 
 
 
164 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  37.91 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  39.68 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.98 
 
 
169 aa  99.4  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.26 
 
 
164 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.62 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.77 
 
 
162 aa  98.2  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.67 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.39 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2084  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294047  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.77 
 
 
170 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  37.67 
 
 
153 aa  94  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.81 
 
 
151 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  37.7 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.7 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.12 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.97 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.41 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.27 
 
 
200 aa  89.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  41.8 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  41.27 
 
 
161 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  39.39 
 
 
273 aa  88.6  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.89 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1242  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.2 
 
 
179 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  39.39 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  39.39 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  40.16 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  40.98 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.11 
 
 
173 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  34.01 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  30.82 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  39.39 
 
 
341 aa  86.3  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  34 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.97 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1856  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.23 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.4 
 
 
185 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  33.57 
 
 
173 aa  84  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.37 
 
 
148 aa  84  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  39.34 
 
 
185 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.65 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  36.97 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.79 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  34.96 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5014  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.25 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.07 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.98 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.97 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  37.7 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.52 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  37.7 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  36.11 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  36.89 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  37.7 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  37.7 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  37.7 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  37.7 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  37.7 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  37.7 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.25 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>