More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf406 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
173 aa  359  8e-99  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.3 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.12 
 
 
159 aa  135  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  42.86 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  41.36 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  49.61 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9348  predicted protein  42.38 
 
 
172 aa  120  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  43.38 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.06 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.36 
 
 
166 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  35.22 
 
 
187 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  35.22 
 
 
187 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.76 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.12 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.18 
 
 
144 aa  97.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.03 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.06 
 
 
147 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36 
 
 
156 aa  92  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.58 
 
 
146 aa  91.3  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.31 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.09 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
145 aa  89  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.48 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.4 
 
 
149 aa  89  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  36.73 
 
 
156 aa  88.2  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  35.81 
 
 
154 aa  88.2  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1856  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.69 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.12 
 
 
155 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.59 
 
 
153 aa  87  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.5 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  35.16 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34 
 
 
155 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.96 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0395  putative deoxycytidylate deaminase  33.33 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  36.18 
 
 
156 aa  85.5  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.14 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.14 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05385  deoxycytidylate deaminase  33.73 
 
 
168 aa  84.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.94 
 
 
151 aa  84.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  37.31 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  38.64 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.31 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.34 
 
 
153 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.71 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.94 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  37.69 
 
 
341 aa  81.6  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0956  putative cytidine and deoxycytidylate deaminase  31.87 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.55 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000505  deoxycytidylate deaminase  32.14 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.55 
 
 
157 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  33.55 
 
 
157 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.99 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  32.28 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  31.61 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  31.72 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3571  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.68 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3657  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.68 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  35.26 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3945  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.77 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.12 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  33.33 
 
 
273 aa  77  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0078  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.06 
 
 
147 aa  77  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  34.21 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3412  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.9 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234898  hitchhiker  0.00117698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3277  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.76 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.11 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.81 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  32.31 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  36.64 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  34.59 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  32.28 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.28 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.28 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  35.88 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.28 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  32.24 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.52 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3746  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.12 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.55 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.58 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.05 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.05 
 
 
135 aa  72  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  30.54 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.35 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.82 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.97 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.17 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  29.09 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.33 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  31.61 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  32.82 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  32.06 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  32.82 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.54 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  32.82 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  29.7 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  32.82 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>