176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3746 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3746  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
150 aa  312  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3571  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.46 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3277  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.76 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.76 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3657  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.76 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3945  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.06 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.46 
 
 
164 aa  90.5  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05385  deoxycytidylate deaminase  38 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0956  putative cytidine and deoxycytidylate deaminase  37.16 
 
 
147 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000505  deoxycytidylate deaminase  38 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0395  putative deoxycytidylate deaminase  38.1 
 
 
166 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0078  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.19 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.54 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.24 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  36.99 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.67 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.41 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.78 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  33.78 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  35.81 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  37.67 
 
 
187 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  37.67 
 
 
187 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.48 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  35.81 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.57 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.56 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.46 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.78 
 
 
151 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  33.78 
 
 
151 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.29 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.11 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.78 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.78 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.14 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.81 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3412  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.43 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234898  hitchhiker  0.00117698 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.09 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.09 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  36.36 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  36.91 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  34.9 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  33.12 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.66 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.46 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.17 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.11 
 
 
158 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.89 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.14 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.97 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  35.04 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.44 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.44 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  37.7 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.19 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.51 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.56 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.9 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  35.62 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.11 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.61 
 
 
174 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.21 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.25 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  31.25 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.61 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.19 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.94 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.65 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  31.97 
 
 
273 aa  62.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.17 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9348  predicted protein  33.06 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  31.36 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.61 
 
 
173 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  28.87 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.77 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.88 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  33.9 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.9 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.9 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.61 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  33.09 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.82 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.8 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  33.61 
 
 
187 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  42.47 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  42.47 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  38.94 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  33.93 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  31.09 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  33.04 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  31.36 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.56 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.61 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0885  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.81 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.29 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.51 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.81 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  30.2 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  29.91 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.54 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>