169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00700 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
156 aa  329  1e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.68 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.37 
 
 
166 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  45.64 
 
 
157 aa  153  8e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.97 
 
 
164 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9348  predicted protein  48.37 
 
 
172 aa  149  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  49.61 
 
 
125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  41.38 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  40.52 
 
 
187 aa  121  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  40.52 
 
 
187 aa  121  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  43.38 
 
 
173 aa  120  7e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.25 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  36.42 
 
 
156 aa  87  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.31 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.31 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0395  putative deoxycytidylate deaminase  42.74 
 
 
166 aa  84  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.19 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.64 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  35.46 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05385  deoxycytidylate deaminase  40 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.32 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.23 
 
 
145 aa  79  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.17 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.96 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000505  deoxycytidylate deaminase  36.62 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3945  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.29 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  32.17 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.79 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.37 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1856  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.43 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0956  putative cytidine and deoxycytidylate deaminase  37.24 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3657  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.11 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0078  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.07 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  35.34 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3571  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.5 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  33.78 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3277  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.51 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.57 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.64 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.4 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  34.43 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.45 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.51 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  31.47 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.56 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  33.33 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.82 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  35.62 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  30.34 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.71 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  35.29 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.07 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  36.67 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  37.4 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  33.33 
 
 
273 aa  70.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.2 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.43 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  34.43 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.43 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.43 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.51 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.97 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.21 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.9 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.03 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  31.62 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.07 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.96 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.6 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.41 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.29 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.28 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.09 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  31.47 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.36 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.5 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.8 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.12 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  32.43 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  34.67 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  33.55 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.25 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5014  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.8 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  33.55 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  33.55 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  29.86 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  33.55 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  33.55 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  33.55 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.67 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  33.55 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  33.55 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  28.67 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  33.55 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  32.89 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.11 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>