229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0956 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0956  putative cytidine and deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
147 aa  309  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0078  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  86.99 
 
 
147 aa  276  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05385  deoxycytidylate deaminase  83.67 
 
 
168 aa  275  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000505  deoxycytidylate deaminase  85.71 
 
 
154 aa  275  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0395  putative deoxycytidylate deaminase  85.03 
 
 
166 aa  273  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  75.86 
 
 
149 aa  246  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3277  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  77.08 
 
 
144 aa  245  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3657  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  75.17 
 
 
145 aa  244  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3571  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  75.69 
 
 
144 aa  244  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3945  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  76.6 
 
 
145 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.21 
 
 
159 aa  114  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.33 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  40.29 
 
 
157 aa  98.6  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  36.91 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3412  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.17 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234898  hitchhiker  0.00117698 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.42 
 
 
166 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.77 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3746  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.16 
 
 
150 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9348  predicted protein  36.36 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  31.87 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.79 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  35.57 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  35.57 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  37.24 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.59 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  27.21 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  32.43 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.21 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  38.94 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  31.25 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  31.29 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.34 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  31.29 
 
 
185 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.23 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  30.61 
 
 
185 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  30.61 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  30.61 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  30.61 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  30.61 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  30.61 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  30.61 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  30.61 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  33.09 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  33.09 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.16 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  30.61 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.39 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  28.57 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  33.33 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.03 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.92 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.13 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  30.34 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  34.21 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.2 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.8 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  31.08 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  30.67 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  33.05 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  27.81 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.41 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.94 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.36 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.93 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  28.57 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.03 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  29.93 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.36 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.62 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.51 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.08 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  31.36 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.14 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.36 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.39 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.08 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.89 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.89 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.63 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.97 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  27.89 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.91 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  33.91 
 
 
341 aa  64.7  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.67 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  32.17 
 
 
273 aa  63.9  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  30.2 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.88 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.08 
 
 
170 aa  63.5  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.05 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.58 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  33.33 
 
 
161 aa  62  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  31.72 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.82 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  29.63 
 
 
162 aa  62  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.58 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.85 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.97 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>