135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0542 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
570 aa  1181    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.97 
 
 
504 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520154  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1865  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.21 
 
 
488 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0309  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.23 
 
 
569 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.632592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1770  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.26 
 
 
522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00425829  normal  0.115514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0536  putative cytidine deaminase  36.97 
 
 
522 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236376  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0119  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.81 
 
 
489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3614  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.84 
 
 
503 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0139  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.91 
 
 
591 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3723  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.32 
 
 
544 aa  203  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.876202  normal  0.78493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0043  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.65 
 
 
520 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3354  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.65 
 
 
209 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  26.62 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0732  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.64 
 
 
609 aa  70.1  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  28 
 
 
158 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.28 
 
 
159 aa  66.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  30.86 
 
 
151 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.86 
 
 
151 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  27.93 
 
 
157 aa  63.9  0.000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.86 
 
 
155 aa  63.9  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  30.86 
 
 
156 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.79 
 
 
156 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30.59 
 
 
162 aa  62  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.34 
 
 
147 aa  60.8  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  30.29 
 
 
154 aa  60.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30 
 
 
145 aa  60.5  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  28.4 
 
 
156 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  25.36 
 
 
341 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.17 
 
 
154 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.71 
 
 
144 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.94 
 
 
148 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.22 
 
 
166 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.66 
 
 
170 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.34 
 
 
168 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  31.48 
 
 
173 aa  58.9  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.85 
 
 
166 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.51 
 
 
149 aa  57.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  29.56 
 
 
153 aa  57.8  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.24 
 
 
152 aa  57.8  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.18 
 
 
155 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.94 
 
 
153 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  28.81 
 
 
156 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.14 
 
 
170 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28 
 
 
169 aa  54.7  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.85 
 
 
159 aa  54.7  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.4 
 
 
161 aa  53.9  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.08 
 
 
144 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  39.06 
 
 
157 aa  53.9  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  27.07 
 
 
164 aa  53.5  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  28.14 
 
 
159 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45 
 
 
155 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.4 
 
 
151 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  41.79 
 
 
146 aa  52.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.06 
 
 
169 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.86 
 
 
200 aa  52.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.06 
 
 
169 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.62 
 
 
149 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.31 
 
 
150 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  45.28 
 
 
154 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  39.62 
 
 
143 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  39.62 
 
 
143 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.82 
 
 
154 aa  51.6  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  24.57 
 
 
187 aa  51.2  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  24.57 
 
 
187 aa  51.2  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.11 
 
 
150 aa  50.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  34.62 
 
 
187 aa  50.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46 
 
 
143 aa  50.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0340  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.59 
 
 
155 aa  50.8  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.68 
 
 
174 aa  50.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9348  predicted protein  26.55 
 
 
172 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.71 
 
 
145 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.81 
 
 
139 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.81 
 
 
139 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.33 
 
 
176 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.98 
 
 
177 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.68 
 
 
147 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.24 
 
 
182 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  37.74 
 
 
153 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.21 
 
 
158 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0885  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.58 
 
 
173 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  50 
 
 
166 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  39.62 
 
 
151 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  39.62 
 
 
156 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  26.45 
 
 
156 aa  48.5  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.49 
 
 
155 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  39.62 
 
 
185 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.23 
 
 
148 aa  48.1  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  37.74 
 
 
166 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  37.74 
 
 
166 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.74 
 
 
166 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44 
 
 
143 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  26.14 
 
 
273 aa  47.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  37.74 
 
 
185 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  37.74 
 
 
185 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  41.18 
 
 
173 aa  47.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  36.36 
 
 
166 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  37.74 
 
 
185 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  37.74 
 
 
185 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  37.74 
 
 
185 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  24.84 
 
 
125 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>