140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0119 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0119  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  100 
 
 
489 aa  1006    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3614  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.9 
 
 
503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0536  putative cytidine deaminase  38.65 
 
 
522 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236376  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1770  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.61 
 
 
522 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00425829  normal  0.115514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0309  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.54 
 
 
569 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.632592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.95 
 
 
504 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.81 
 
 
570 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3723  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.53 
 
 
544 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.876202  normal  0.78493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0043  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.72 
 
 
520 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1865  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.22 
 
 
488 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0139  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.33 
 
 
591 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3354  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.57 
 
 
209 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0732  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.78 
 
 
609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.85 
 
 
299 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  34.66 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.67 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.22 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.11 
 
 
152 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  32.99 
 
 
154 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  33.15 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.39 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.18 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.53 
 
 
154 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.78 
 
 
148 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.22 
 
 
147 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  30.56 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.84 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  30 
 
 
151 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 
151 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
145 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.56 
 
 
144 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30 
 
 
153 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  45.45 
 
 
143 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  45.45 
 
 
143 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  45.45 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  29.83 
 
 
159 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  31.52 
 
 
153 aa  65.9  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  42.25 
 
 
162 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 
145 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.59 
 
 
154 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  30.39 
 
 
157 aa  64.7  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  45.31 
 
 
151 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1248  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.7 
 
 
170 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.639553  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 
158 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.7 
 
 
168 aa  63.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.31 
 
 
150 aa  63.5  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.59 
 
 
155 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  29.7 
 
 
125 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.53 
 
 
169 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.34 
 
 
170 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.53 
 
 
169 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  49.02 
 
 
146 aa  61.6  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.38 
 
 
155 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.1 
 
 
182 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.86 
 
 
155 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.65 
 
 
159 aa  60.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.63 
 
 
200 aa  60.8  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  31.33 
 
 
173 aa  60.5  0.00000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  28.48 
 
 
173 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  40.91 
 
 
151 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  33.7 
 
 
156 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  41.94 
 
 
161 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.9 
 
 
150 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
151 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  49.06 
 
 
158 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  24.59 
 
 
187 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  24.59 
 
 
187 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.9 
 
 
176 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  33.33 
 
 
185 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.33 
 
 
149 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.22 
 
 
159 aa  58.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  48.28 
 
 
154 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.98 
 
 
153 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.94 
 
 
148 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.27 
 
 
153 aa  57  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  29.59 
 
 
341 aa  57  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.37 
 
 
170 aa  57  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  42.62 
 
 
157 aa  56.6  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  40.32 
 
 
156 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.44 
 
 
166 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.14 
 
 
169 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  38.71 
 
 
159 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  25.61 
 
 
166 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  36.36 
 
 
185 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  26.49 
 
 
164 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  25.77 
 
 
156 aa  54.7  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  36.36 
 
 
185 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  36.36 
 
 
185 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  36.36 
 
 
185 aa  54.7  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  36.36 
 
 
185 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.06 
 
 
177 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  36.36 
 
 
185 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.61 
 
 
174 aa  53.9  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  44.87 
 
 
165 aa  53.5  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.61 
 
 
173 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.7 
 
 
153 aa  53.5  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  37.1 
 
 
185 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>