114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0139 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0139  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  100 
 
 		 591 aa  1219    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0043  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.23 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3723  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.85 
 
 		 544 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.876202  normal  0.78493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3614  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.49 
 
 		 503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0536  putative cytidine deaminase  32.77 
 
 		 522 aa  239  9e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236376  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1770  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.14 
 
 		 522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00425829  normal  0.115514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.91 
 
 		 570 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0119  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.33 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1865  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.94 
 
 		 488 aa  228  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.45 
 
 		 504 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0309  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.18 
 
 		 569 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3354  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.32 
 
 		 209 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.22 
 
 		 299 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0732  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.19 
 
 		 609 aa  107  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.61 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.05 
 
 		 155 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.03 
 
 		 158 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  29.61 
 
 		 156 aa  62.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.55 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.51 
 
 		 152 aa  61.6  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  30.68 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.13 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  30.11 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  27.84 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.63 
 
 		 145 aa  60.1  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.23 
 
 		 155 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  27.96 
 
 		 159 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  30.11 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.16 
 
 		 155 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  35.16 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.55 
 
 		 161 aa  58.5  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.38 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  26.01 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.4 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  28.4 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.75 
 
 		 168 aa  57  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.36 
 
 		 169 aa  56.6  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.84 
 
 		 153 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.32 
 
 		 166 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.67 
 
 		 148 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.78 
 
 		 170 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.75 
 
 		 166 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.49 
 
 		 144 aa  54.7  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.49 
 
 		 147 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.32 
 
 		 182 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.41 
 
 		 153 aa  53.9  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  27.03 
 
 		 157 aa  53.9  0.000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  41.82 
 
 		 154 aa  53.9  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.4 
 
 		 153 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  40 
 
 		 125 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  30.56 
 
 		 185 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  30.56 
 
 		 185 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  28.12 
 
 		 156 aa  52.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  40 
 
 		 153 aa  52  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  26.7 
 
 		 162 aa  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  36.36 
 
 		 156 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  38.1 
 
 		 153 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  40 
 
 		 143 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  40 
 
 		 143 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  28.83 
 
 		 185 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  27.78 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  27.78 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  27.78 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  27.78 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  27.78 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.1 
 
 		 157 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  34.33 
 
 		 185 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.98 
 
 		 170 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26 
 
 		 154 aa  49.7  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  43.1 
 
 		 173 aa  49.3  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  27.78 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  27.78 
 
 		 185 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  36.51 
 
 		 162 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  40.35 
 
 		 158 aa  48.5  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  38.18 
 
 		 151 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.9 
 
 		 159 aa  48.1  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.91 
 
 		 145 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  35.38 
 
 		 161 aa  47.4  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  42.86 
 
 		 146 aa  47  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.68 
 
 		 150 aa  46.6  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  38.98 
 
 		 145 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.49 
 
 		 151 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  38.98 
 
 		 145 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  44.23 
 
 		 146 aa  47  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  40.68 
 
 		 145 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.51 
 
 		 148 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  41.51 
 
 		 173 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  38.98 
 
 		 145 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1248  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.81 
 
 		 170 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.639553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.98 
 
 		 145 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  26.25 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.21 
 
 		 174 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.51 
 
 		 177 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  41.51 
 
 		 187 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.89 
 
 		 135 aa  45.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  34.18 
 
 		 159 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  38.1 
 
 		 151 aa  45.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.22 
 
 		 167 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 		 151 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>