139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1248 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1248  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
170 aa  352  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.639553  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.65 
 
 
169 aa  117  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.36 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.61 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.92 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.75 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.72 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.59 
 
 
155 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.74 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.36 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.97 
 
 
169 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.97 
 
 
169 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.33 
 
 
152 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.74 
 
 
155 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  43.97 
 
 
156 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.14 
 
 
148 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.36 
 
 
154 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  41.67 
 
 
154 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  37.13 
 
 
151 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.13 
 
 
151 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  34.73 
 
 
156 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.58 
 
 
153 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.24 
 
 
147 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  42.36 
 
 
156 aa  101  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  38.27 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.62 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.65 
 
 
144 aa  97.1  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.2 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.78 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.33 
 
 
162 aa  94.4  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.99 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.58 
 
 
145 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.95 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  36.3 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.3 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.3 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.65 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.58 
 
 
182 aa  91.3  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  32.34 
 
 
273 aa  90.9  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.96 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.34 
 
 
155 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.54 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  33.94 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  32.76 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.36 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  34.75 
 
 
187 aa  85.1  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.16 
 
 
158 aa  84.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131735  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.12 
 
 
173 aa  84  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  34.42 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.71 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.12 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0189  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.1 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2084  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.41 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294047  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.62 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  29.52 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.23 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.69 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.62 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  36.62 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.48 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.43 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  33.09 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5014  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.81 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  28.74 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  31.91 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.94 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  32.52 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.79 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.04 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  33.78 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.18 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0885  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.98 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1242  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.53 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  29.89 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0627  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.82 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.45 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  28.14 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  31.21 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  27.71 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07429  deoxycytidylate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06240)  50 
 
 
314 aa  67.4  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000522254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  26.35 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  27.88 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.47 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  26.35 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  26.35 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  26.35 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  26.35 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0119  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  33.7 
 
 
489 aa  64.7  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  26.35 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  26.35 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  26.35 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  26.35 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  25.75 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  27.56 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  31.51 
 
 
125 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  25.95 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.85 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>