112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0309 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0309  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
569 aa  1175    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.632592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1770  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.67 
 
 
522 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00425829  normal  0.115514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.89 
 
 
504 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.23 
 
 
570 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1865  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.17 
 
 
488 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0536  putative cytidine deaminase  37.04 
 
 
522 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236376  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0119  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.54 
 
 
489 aa  277  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3614  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.24 
 
 
503 aa  270  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3723  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.58 
 
 
544 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.876202  normal  0.78493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0139  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.11 
 
 
591 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0043  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.66 
 
 
520 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3354  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.45 
 
 
209 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.34 
 
 
299 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0732  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.85 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  27.01 
 
 
158 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.59 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.88 
 
 
145 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.65 
 
 
151 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  28.65 
 
 
151 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  27.84 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  43.66 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.65 
 
 
148 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  29.08 
 
 
156 aa  67  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  46.88 
 
 
154 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.75 
 
 
155 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.69 
 
 
159 aa  63.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.74 
 
 
154 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.65 
 
 
176 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  36.11 
 
 
143 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  36.11 
 
 
143 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.56 
 
 
152 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.24 
 
 
155 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.36 
 
 
158 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.71 
 
 
155 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  46.15 
 
 
146 aa  60.1  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.86 
 
 
147 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.71 
 
 
182 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.18 
 
 
149 aa  58.9  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.18 
 
 
144 aa  58.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  34.26 
 
 
153 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  38.24 
 
 
159 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  39.06 
 
 
151 aa  56.6  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.24 
 
 
153 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.21 
 
 
155 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  24.87 
 
 
173 aa  55.8  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.92 
 
 
151 aa  55.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.83 
 
 
170 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.82 
 
 
153 aa  54.7  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  32.33 
 
 
161 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.06 
 
 
161 aa  54.7  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  39.34 
 
 
157 aa  54.7  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.71 
 
 
145 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  40.68 
 
 
173 aa  53.9  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  43.4 
 
 
162 aa  54.3  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.23 
 
 
170 aa  53.9  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.1 
 
 
148 aa  53.9  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.29 
 
 
154 aa  53.9  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.5 
 
 
150 aa  53.5  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.98 
 
 
173 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.06 
 
 
150 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.98 
 
 
174 aa  53.5  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.68 
 
 
177 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  42.86 
 
 
165 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  40.38 
 
 
156 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  37.1 
 
 
158 aa  52.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.98 
 
 
174 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  39.39 
 
 
151 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.42 
 
 
151 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.35 
 
 
169 aa  52  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.35 
 
 
169 aa  52  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.14 
 
 
174 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  23.68 
 
 
273 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  38.98 
 
 
187 aa  51.6  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  39.39 
 
 
156 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.29 
 
 
149 aa  51.2  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.44 
 
 
168 aa  50.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.1 
 
 
153 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  50.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.74 
 
 
169 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  25.71 
 
 
157 aa  48.9  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  41.38 
 
 
154 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.88 
 
 
153 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  37.88 
 
 
185 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3746  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.62 
 
 
150 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.38 
 
 
159 aa  47  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.27 
 
 
169 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  41.18 
 
 
164 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.23 
 
 
143 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 
164 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 
164 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.23 
 
 
146 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>