109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0732 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0732  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
609 aa  1254    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0119  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  27.78 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3723  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.14 
 
 
544 aa  104  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.876202  normal  0.78493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0043  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.03 
 
 
520 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0139  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  25.19 
 
 
591 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3614  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  25.45 
 
 
503 aa  88.6  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0536  putative cytidine deaminase  25.72 
 
 
522 aa  80.9  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236376  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  28.96 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1865  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.32 
 
 
488 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.32 
 
 
162 aa  75.5  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0309  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.85 
 
 
569 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.632592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.18 
 
 
152 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.25 
 
 
155 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.55 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  25.91 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.21 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.64 
 
 
570 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.68 
 
 
145 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  28.16 
 
 
156 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.83 
 
 
154 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.02 
 
 
504 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520154  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  27.84 
 
 
161 aa  68.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  26.7 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  26.7 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1770  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  24.07 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00425829  normal  0.115514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.86 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  25.86 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.27 
 
 
148 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  23.2 
 
 
159 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.12 
 
 
168 aa  63.9  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.71 
 
 
147 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.34 
 
 
169 aa  63.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.47 
 
 
170 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.06 
 
 
170 aa  62.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.34 
 
 
169 aa  63.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  28.72 
 
 
157 aa  62.4  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.01 
 
 
156 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.59 
 
 
144 aa  60.8  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.86 
 
 
155 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  29.52 
 
 
159 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.11 
 
 
299 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.21 
 
 
158 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.56 
 
 
145 aa  57.4  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.81 
 
 
135 aa  57  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.1 
 
 
155 aa  57  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28 
 
 
200 aa  57  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3354  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 
209 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  23.16 
 
 
176 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.7 
 
 
149 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28 
 
 
151 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  26.51 
 
 
186 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.59 
 
 
169 aa  55.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.75 
 
 
153 aa  55.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  23.35 
 
 
155 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  22.92 
 
 
182 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.9 
 
 
164 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  23.56 
 
 
151 aa  53.9  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  25.9 
 
 
160 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  25.29 
 
 
159 aa  53.5  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.98 
 
 
151 aa  53.5  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  36.84 
 
 
143 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  36.84 
 
 
143 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  44.44 
 
 
161 aa  52  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.68 
 
 
146 aa  52  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.89 
 
 
153 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.23 
 
 
143 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  24.26 
 
 
187 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  35.79 
 
 
164 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  25 
 
 
146 aa  49.7  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  23.67 
 
 
173 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  23.7 
 
 
157 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.85 
 
 
174 aa  49.7  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 
164 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 
164 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  22.16 
 
 
153 aa  49.7  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  22.54 
 
 
157 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  22.54 
 
 
157 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  23.67 
 
 
174 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.44 
 
 
177 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  24.28 
 
 
156 aa  48.5  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  40.68 
 
 
154 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  33.8 
 
 
165 aa  48.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  40.74 
 
 
153 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  23.08 
 
 
174 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  31.58 
 
 
156 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  33.9 
 
 
173 aa  47.4  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  30.53 
 
 
151 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  23.08 
 
 
173 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  35.19 
 
 
158 aa  47  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0885  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.4 
 
 
173 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.74 
 
 
164 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  23.53 
 
 
273 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  25.93 
 
 
125 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  30.34 
 
 
185 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  31.46 
 
 
185 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  30.34 
 
 
185 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  30.34 
 
 
185 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.38 
 
 
143 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  26.61 
 
 
187 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  30.34 
 
 
185 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>