223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0388 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0388  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5343  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.78 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.72 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  22.91 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  24.73 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1231  Cof-like hydrolase  23.22 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  23.95 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  28 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  34.41 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  24.15 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  23.41 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2044  Cof-like hydrolase  24.48 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133018  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  28 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  28 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  28 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3942  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.78 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000956617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  22.3 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  27 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  27 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  22.55 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1562  Cof-like hydrolase  34.15 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104668  normal  0.0533762 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  19.43 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  22.96 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  21.95 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  28 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  23.67 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3941  Cof-like hydrolase  22.68 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00611746  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  23.36 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  35.8 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4533  hypothetical protein  31.76 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4607  hypothetical protein  31.76 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  26.95 
 
 		 462 aa  52.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  31.58 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  34.19 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  22.53 
 
 		 226 aa  52  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1482  Cof-like hydrolase  20.42 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00113579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  31.87 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3893  Cof-like hydrolase  36.92 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.805334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.87 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  33.78 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  35.38 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  22.71 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4133  HAD family hydrolase  35.38 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.38 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0996454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3974  HAD family hydrolase  35.38 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3804  HAD-superfamily hydrolase  35.38 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3819  HAD-superfamily hydrolase  35.38 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126763  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4408  putative conserved hypothetical protein  31.76 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.38 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119194 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4285  HAD family hydrolase  35.38 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  21.15 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4172  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.85 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0575456  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  30.43 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  36.49 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  36.49 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.72 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  28.42 
 
 		 460 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  36.49 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3962  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4072  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.77 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0578925 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3808  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0549007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  22.27 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4271  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.596112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  36.49 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  24.14 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  36.49 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  36.49 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  36.49 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1066  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.85 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840959  normal  0.475939 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  36.49 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  21.58 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1580  Cof-like hydrolase  31.46 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  33.77 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  34.25 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  34.18 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  21.99 
 
 		 296 aa  48.9  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00157591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1489  Cof-like hydrolase  33.78 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  23.38 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  32.47 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  35.14 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  22.95 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3881  Cof-like hydrolase  27.47 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0852167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  32.32 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  33.33 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0866  SPP-like hydrolase  36 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0630  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.22 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  25 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  36.84 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  24.6 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>