63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6392 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2118  twin-arginine translocation pathway signal  71.12 
 
 		 557 aa  761    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6392  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 546 aa  1118    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7356  ABC transporter, binding protein  68.61 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.53 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  30.04 
 
 		 484 aa  178  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 458 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  28.18 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.92 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  27.63 
 
 		 440 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 435 aa  53.9  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 436 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 436 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 436 aa  53.5  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 436 aa  51.6  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 435 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 437 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 440 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  25.69 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 447 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.68 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  31.68 
 
 		 425 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3415  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3169  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  21.86 
 
 		 573 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000122164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  26.56 
 
 		 368 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 439 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 439 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 455 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 478 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.67 
 
 		 496 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 412 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 446 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 455 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 455 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 436 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>