48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2118 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6392  extracellular solute-binding protein family 1  71.12 
 
 		 546 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2118  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 557 aa  1138    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7356  ABC transporter, binding protein  70.5 
 
 		 457 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  30.5 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.33 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  25.08 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 447 aa  60.1  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 435 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3169  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  21.81 
 
 		 573 aa  55.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000122164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  21.26 
 
 		 433 aa  54.3  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 439 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  20.97 
 
 		 484 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 458 aa  47.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  24.61 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2204  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 579 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  24.58 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 454 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2229  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 580 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0301867  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 437 aa  44.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 574 aa  43.9  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.26 
 
 		 326 aa  43.5  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.79 
 
 		 438 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.11 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.11 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.11 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.11 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.11 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  23.11 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>