More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1673 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1188  penicillin-binding protein transpeptidase  56.51 
 
 		 767 aa  697    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1280  peptidoglycan glycosyltransferase  85.73 
 
 		 888 aa  1556    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1673  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 899 aa  1820    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4774  penicillin-binding protein transpeptidase  41.13 
 
 		 750 aa  473  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.92 
 
 		 639 aa  249  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.83 
 
 		 645 aa  249  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 636 aa  238  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 		 655 aa  238  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 		 643 aa  228  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 636 aa  225  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 671 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 		 633 aa  221  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 		 637 aa  218  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  31.96 
 
 		 701 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.72 
 
 		 642 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  27.6 
 
 		 661 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.62 
 
 		 645 aa  213  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  29.72 
 
 		 646 aa  211  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.23 
 
 		 647 aa  211  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.48 
 
 		 619 aa  211  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 633 aa  210  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  29.64 
 
 		 646 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  27.54 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  27.7 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  27.54 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  27.7 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  27.7 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 646 aa  209  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  27.7 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  31.42 
 
 		 663 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  27.7 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  30.36 
 
 		 637 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 		 615 aa  208  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 609 aa  208  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  29.43 
 
 		 803 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  29.43 
 
 		 803 aa  207  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1624  penicillin-binding protein 2  28.99 
 
 		 738 aa  207  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  29.43 
 
 		 809 aa  207  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  28.87 
 
 		 681 aa  207  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  29.17 
 
 		 640 aa  207  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  31.56 
 
 		 686 aa  206  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  30.04 
 
 		 802 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  29.48 
 
 		 802 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  29.48 
 
 		 802 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  29.48 
 
 		 802 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  29.48 
 
 		 802 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  28.16 
 
 		 617 aa  204  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.64 
 
 		 631 aa  203  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 		 630 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  30.5 
 
 		 800 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 		 629 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  29.64 
 
 		 646 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 631 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  29.68 
 
 		 631 aa  201  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  28.5 
 
 		 801 aa  200  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  27.35 
 
 		 633 aa  201  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  28.7 
 
 		 652 aa  200  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  28.52 
 
 		 801 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  29.11 
 
 		 646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  29.04 
 
 		 716 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  30.08 
 
 		 625 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  27.44 
 
 		 631 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  28.35 
 
 		 801 aa  199  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  27.29 
 
 		 631 aa  198  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 		 646 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  27.44 
 
 		 631 aa  198  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  27.91 
 
 		 610 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  30.31 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  28.52 
 
 		 629 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 		 630 aa  196  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  26.7 
 
 		 628 aa  196  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  28.2 
 
 		 703 aa  195  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.69 
 
 		 641 aa  195  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  30.31 
 
 		 615 aa  195  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  29.87 
 
 		 632 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 		 643 aa  194  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  28.77 
 
 		 629 aa  194  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  28.03 
 
 		 643 aa  194  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  29.31 
 
 		 687 aa  193  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  28.23 
 
 		 629 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  29.86 
 
 		 756 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 		 634 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 		 765 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  29.02 
 
 		 631 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  26.61 
 
 		 618 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  26.61 
 
 		 618 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 		 765 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  26.61 
 
 		 618 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  26.75 
 
 		 709 aa  193  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  29.56 
 
 		 760 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  27.3 
 
 		 664 aa  192  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  27.86 
 
 		 630 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  28.16 
 
 		 599 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  26.88 
 
 		 618 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>